Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,24■□□□□ 0,03
Gm21887J3QQ04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Gm21887J3QQ04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,92□□□□□ -0,02
Gm21887J3QQ04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
Gm21887J3QQ04 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14,77□□□□□ -0,05
Gm21887J3QQ04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,59□□□□□ -0,07
Gm21887J3QQ04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC14,5□□□□□ -0,09
Gm21887J3QQ04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC14,46□□□□□ -0,09
Gm21887J3QQ04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm21887J3QQ04 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14,27□□□□□ -0,13
Gm21887J3QQ04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14,13□□□□□ -0,15
Gm21887J3QQ04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Gm21887J3QQ04 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,03□□□□□ -0,16
Gm21887J3QQ04 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14,01□□□□□ -0,17
Gm21887J3QQ04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13,95□□□□□ -0,18
Gm21887J3QQ04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,92□□□□□ -0,18
Gm21887J3QQ04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Gm21887J3QQ04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13,9□□□□□ -0,18
Gm21887J3QQ04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Gm21887J3QQ04 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13,87□□□□□ -0,19
Gm21887J3QQ04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC13,85□□□□□ -0,19
Gm21887J3QQ04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,83□□□□□ -0,2
Gm21887J3QQ04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,81□□□□□ -0,2
Gm21887J3QQ04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Gm21887J3QQ04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Gm21887J3QQ04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,66□□□□□ -0,22
Gm21887J3QQ04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Gm21887J3QQ04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,64□□□□□ -0,23
Gm21887J3QQ04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13,6□□□□□ -0,23
Gm21887J3QQ04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Gm21887J3QQ04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,58□□□□□ -0,24
Gm21887J3QQ04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Gm21887J3QQ04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Gm21887J3QQ04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Gm21887J3QQ04 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13,52□□□□□ -0,25
Gm21887J3QQ04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Gm21887J3QQ04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Gm21887J3QQ04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Gm21887J3QQ04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,46□□□□□ -0,25
Gm21887J3QQ04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC13,37□□□□□ -0,27
Gm21887J3QQ04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Gm21887J3QQ04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC13,31□□□□□ -0,28
Gm21887J3QQ04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,31□□□□□ -0,28
Gm21887J3QQ04 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13,27□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13,23□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC13,22□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13,21□□□□□ -0,29
Gm21887J3QQ04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,19□□□□□ -0,3
Gm21887J3QQ04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Gm21887J3QQ04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,18□□□□□ -0,3
Gm21887J3QQ04 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13,14□□□□□ -0,31
Gm21887J3QQ04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13,06□□□□□ -0,32
Gm21887J3QQ04 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13,05□□□□□ -0,32
Gm21887J3QQ04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,04□□□□□ -0,32
Gm21887J3QQ04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,02□□□□□ -0,33
Gm21887J3QQ04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC12,97□□□□□ -0,33
Gm21887J3QQ04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC12,97□□□□□ -0,33
Gm21887J3QQ04 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,95□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC12,95□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC12,94□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC12,93□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,92□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12,9□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12,9□□□□□ -0,34
Gm21887J3QQ04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC12,89□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,89□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,88□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC12,84□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12,84□□□□□ -0,35
Gm21887J3QQ04 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC12,81□□□□□ -0,36
Gm21887J3QQ04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,81□□□□□ -0,36
Gm21887J3QQ04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,79□□□□□ -0,36
Gm21887J3QQ04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Gm21887J3QQ04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,74□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12,73□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,73□□□□□ -0,37
Gm21887J3QQ04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,68□□□□□ -0,38
Gm21887J3QQ04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12,67□□□□□ -0,38
Gm21887J3QQ04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC12,67□□□□□ -0,38
Gm21887J3QQ04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,65□□□□□ -0,38
Gm21887J3QQ04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC12,65□□□□□ -0,38
Gm21887J3QQ04 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12,64□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12,62□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC12,61□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,61□□□□□ -0,39
Gm21887J3QQ04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,6□□□□□ -0,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms