Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Derl1Q99J56 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Derl1Q99J56 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Derl1Q99J56 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Derl1Q99J56 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Derl1Q99J56 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Derl1Q99J56 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Derl1Q99J56 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Derl1Q99J56 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Derl1Q99J56 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Derl1Q99J56 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Derl1Q99J56 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Derl1Q99J56 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Derl1Q99J56 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Derl1Q99J56 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Derl1Q99J56 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Derl1Q99J56 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Derl1Q99J56 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Derl1Q99J56 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Derl1Q99J56 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Derl1Q99J56 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Derl1Q99J56 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Derl1Q99J56 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Derl1Q99J56 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Derl1Q99J56 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Derl1Q99J56 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Derl1Q99J56 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Derl1Q99J56 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Derl1Q99J56 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Derl1Q99J56 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Derl1Q99J56 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Derl1Q99J56 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Derl1Q99J56 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Derl1Q99J56 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Derl1Q99J56 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Derl1Q99J56 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Derl1Q99J56 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Derl1Q99J56 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Derl1Q99J56 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Derl1Q99J56 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Derl1Q99J56 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Derl1Q99J56 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Derl1Q99J56 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Derl1Q99J56 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Derl1Q99J56 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Derl1Q99J56 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Derl1Q99J56 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Derl1Q99J56 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Derl1Q99J56 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Derl1Q99J56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Derl1Q99J56 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Derl1Q99J56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Derl1Q99J56 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Derl1Q99J56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Derl1Q99J56 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Derl1Q99J56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Derl1Q99J56 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Derl1Q99J56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Derl1Q99J56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Derl1Q99J56 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Derl1Q99J56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Derl1Q99J56 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Derl1Q99J56 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Derl1Q99J56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Derl1Q99J56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Derl1Q99J56 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Derl1Q99J56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Derl1Q99J56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Derl1Q99J56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Derl1Q99J56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Derl1Q99J56 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Derl1Q99J56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Derl1Q99J56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Derl1Q99J56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Derl1Q99J56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Derl1Q99J56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Derl1Q99J56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Derl1Q99J56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Derl1Q99J56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Derl1Q99J56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Derl1Q99J56 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Derl1Q99J56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Derl1Q99J56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Derl1Q99J56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Derl1Q99J56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Derl1Q99J56 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Derl1Q99J56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Derl1Q99J56 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Derl1Q99J56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Derl1Q99J56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Derl1Q99J56 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Derl1Q99J56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Derl1Q99J56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Derl1Q99J56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Derl1Q99J56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms