Protein–RNA interactions for Protein: Q61224

Htr1d, 5-hydroxytryptamine receptor 1D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1dQ61224 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Htr1dQ61224 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Htr1dQ61224 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Htr1dQ61224 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Htr1dQ61224 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Htr1dQ61224 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Htr1dQ61224 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Htr1dQ61224 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Htr1dQ61224 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Htr1dQ61224 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Htr1dQ61224 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Htr1dQ61224 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Htr1dQ61224 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Htr1dQ61224 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Htr1dQ61224 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
Htr1dQ61224 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
Htr1dQ61224 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Htr1dQ61224 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Htr1dQ61224 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Htr1dQ61224 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Htr1dQ61224 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Htr1dQ61224 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Htr1dQ61224 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Htr1dQ61224 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Htr1dQ61224 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Htr1dQ61224 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Htr1dQ61224 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Htr1dQ61224 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Htr1dQ61224 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Htr1dQ61224 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Htr1dQ61224 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Htr1dQ61224 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Htr1dQ61224 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Htr1dQ61224 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Htr1dQ61224 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Htr1dQ61224 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Htr1dQ61224 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Htr1dQ61224 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Htr1dQ61224 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Htr1dQ61224 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Htr1dQ61224 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Htr1dQ61224 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Htr1dQ61224 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Htr1dQ61224 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Htr1dQ61224 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Htr1dQ61224 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Htr1dQ61224 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Htr1dQ61224 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Htr1dQ61224 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Htr1dQ61224 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Htr1dQ61224 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Htr1dQ61224 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Htr1dQ61224 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
Htr1dQ61224 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Htr1dQ61224 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Htr1dQ61224 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Htr1dQ61224 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Htr1dQ61224 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Htr1dQ61224 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Htr1dQ61224 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Htr1dQ61224 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Htr1dQ61224 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Htr1dQ61224 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Htr1dQ61224 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Htr1dQ61224 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Htr1dQ61224 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Htr1dQ61224 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Htr1dQ61224 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Htr1dQ61224 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Htr1dQ61224 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Htr1dQ61224 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Htr1dQ61224 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Htr1dQ61224 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Htr1dQ61224 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Htr1dQ61224 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Htr1dQ61224 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Htr1dQ61224 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Htr1dQ61224 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Htr1dQ61224 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Htr1dQ61224 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Htr1dQ61224 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Htr1dQ61224 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Htr1dQ61224 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Htr1dQ61224 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,24■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Htr1dQ61224 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Htr1dQ61224 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Htr1dQ61224 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Htr1dQ61224 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Htr1dQ61224 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
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