Protein–RNA interactions for Protein: Q99PW4

Tp53rk, TP53-regulating kinase, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53rkQ99PW4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tp53rkQ99PW4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53rkQ99PW4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tp53rkQ99PW4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tp53rkQ99PW4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tp53rkQ99PW4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tp53rkQ99PW4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tp53rkQ99PW4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53rkQ99PW4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53rkQ99PW4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53rkQ99PW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tp53rkQ99PW4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tp53rkQ99PW4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tp53rkQ99PW4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tp53rkQ99PW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tp53rkQ99PW4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53rkQ99PW4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53rkQ99PW4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tp53rkQ99PW4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tp53rkQ99PW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tp53rkQ99PW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53rkQ99PW4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53rkQ99PW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53rkQ99PW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53rkQ99PW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53rkQ99PW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53rkQ99PW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53rkQ99PW4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53rkQ99PW4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53rkQ99PW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53rkQ99PW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53rkQ99PW4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53rkQ99PW4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53rkQ99PW4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53rkQ99PW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53rkQ99PW4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53rkQ99PW4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53rkQ99PW4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53rkQ99PW4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53rkQ99PW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53rkQ99PW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53rkQ99PW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53rkQ99PW4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53rkQ99PW4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53rkQ99PW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53rkQ99PW4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53rkQ99PW4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53rkQ99PW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53rkQ99PW4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53rkQ99PW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53rkQ99PW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53rkQ99PW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tp53rkQ99PW4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53rkQ99PW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53rkQ99PW4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53rkQ99PW4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53rkQ99PW4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53rkQ99PW4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53rkQ99PW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53rkQ99PW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53rkQ99PW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53rkQ99PW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53rkQ99PW4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53rkQ99PW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53rkQ99PW4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53rkQ99PW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53rkQ99PW4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53rkQ99PW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tp53rkQ99PW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tp53rkQ99PW4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tp53rkQ99PW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tp53rkQ99PW4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53rkQ99PW4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tp53rkQ99PW4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53rkQ99PW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tp53rkQ99PW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tp53rkQ99PW4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53rkQ99PW4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53rkQ99PW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53rkQ99PW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tp53rkQ99PW4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tp53rkQ99PW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tp53rkQ99PW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53rkQ99PW4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tp53rkQ99PW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tp53rkQ99PW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tp53rkQ99PW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms