Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nkx6-2D3Z4R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Nkx6-2D3Z4R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Nkx6-2D3Z4R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Nkx6-2D3Z4R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Nkx6-2D3Z4R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Nkx6-2D3Z4R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nkx6-2D3Z4R4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Nkx6-2D3Z4R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Nkx6-2D3Z4R4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Nkx6-2D3Z4R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Nkx6-2D3Z4R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Nkx6-2D3Z4R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Nkx6-2D3Z4R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Nkx6-2D3Z4R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Nkx6-2D3Z4R4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Nkx6-2D3Z4R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Nkx6-2D3Z4R4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Nkx6-2D3Z4R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Nkx6-2D3Z4R4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Nkx6-2D3Z4R4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Nkx6-2D3Z4R4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Nkx6-2D3Z4R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Nkx6-2D3Z4R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Nkx6-2D3Z4R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Nkx6-2D3Z4R4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Nkx6-2D3Z4R4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Nkx6-2D3Z4R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Nkx6-2D3Z4R4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Nkx6-2D3Z4R4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Nkx6-2D3Z4R4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Nkx6-2D3Z4R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Nkx6-2D3Z4R4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Nkx6-2D3Z4R4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Nkx6-2D3Z4R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Nkx6-2D3Z4R4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Nkx6-2D3Z4R4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Nkx6-2D3Z4R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Nkx6-2D3Z4R4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Nkx6-2D3Z4R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Nkx6-2D3Z4R4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Nkx6-2D3Z4R4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Nkx6-2D3Z4R4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,27
Nkx6-2D3Z4R4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Nkx6-2D3Z4R4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Nkx6-2D3Z4R4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Nkx6-2D3Z4R4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Nkx6-2D3Z4R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Nkx6-2D3Z4R4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Nkx6-2D3Z4R4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Nkx6-2D3Z4R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Nkx6-2D3Z4R4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Nkx6-2D3Z4R4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Nkx6-2D3Z4R4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Nkx6-2D3Z4R4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Nkx6-2D3Z4R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
Nkx6-2D3Z4R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Nkx6-2D3Z4R4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Nkx6-2D3Z4R4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Nkx6-2D3Z4R4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Nkx6-2D3Z4R4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Nkx6-2D3Z4R4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Nkx6-2D3Z4R4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Nkx6-2D3Z4R4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
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