RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	PLC1	P32383	869 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	MAM1	P40065	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	PFA4	Q12006	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YCR043C	P25361	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	STB5	P38699	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	VPS8	P39702	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YJR142W	P47173	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YGR237C	P50089	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	SKY1	Q03656	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	PLM2	Q04383	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	DSE3	Q08729	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	SCO2	P38072	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	VTC3	Q02725	835 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	YML053C	Q04978	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CSI1	YMR025W	URA3	P03962	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	ERV46	P39727	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	EAF5	P39995	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	ARA2	Q04212	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	RAD26	P40352	1085 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	RMP1	Q12530	201 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	AAT1	Q01802	451 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	MLH2	Q07980	695 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	NRT1	Q08485	598 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	HOS1	Q12214	470 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	GRS2	Q06817	618 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	RRI1	Q12468	440 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	CNA1	P23287	553 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	LNP1	P38878	278 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	IDS2	P46958	469 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	MAD2	P40958	196 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YPT11	P48559	417 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YNR071C	P53757	342 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	DIN7	Q12086	430 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSI1	YMR025W	MET30	P39014	640 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YJL107C	P42947	387 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	GSM1	P42950	618 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YAT1	P80235	687 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	ACS1	Q01574	713 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	PHO2	P07269	559 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YCR061W	P25639	631 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YIL169C	P40442	995 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YGL260W	P53056	76 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	SCW10	Q04951	389 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	GSH1	P32477	678 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	UBP7	P40453	1071 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	NIT2	P47016	307 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	ORC5	P50874	479 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YNL144C	P53907	740 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	STL1	P39932	569 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	SPC105	P53148	917 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	RTT107	P38850	1070 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	GSH2	Q08220	491 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	ARN1	P38731	627 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CSI1	YMR025W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	SLD3	P53135	668 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	HOL1	P53389	586 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	CRF1	Q04930	467 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	NIC96	P34077	839 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	VFA1	P40080	203 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	TRS31	Q03337	283 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSI1	YMR025W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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