RNA–Protein interactions for RNA: YLL058W

YLL058W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to Str2p, yeastyeast

Gene YLL058W, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL058WYLL058W PGS1P25578 521 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W CSE1P33307 960 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W ECM2P38241 364 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W TIF5P38431 405 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W TMA108P40462 946 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W YML6P51998 286 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W NMA111P53920 997 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W GCN5Q03330 439 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W THI20Q08224 551 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W YPL191CQ08930 360 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W TAF10Q12030 206 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W YDR018CQ12185 396 aa7.09□□□□□ -1.27
YLL058WYLL058W TEF1P02994 458 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ATP1P07251 545 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W TUB3P09734 445 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PDE1P22434 369 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RAD27P26793 382 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ITR1P30605 584 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W VPH1P32563 840 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MIA40P36046 403 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PCA1P38360 1216 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RAD55P38953 406 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YMR134WP40207 237 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RRT5P43607 289 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W KTR6P54070 446 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YMR102CQ03177 834 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W THI7Q05998 598 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SDH5Q08230 162 aa7.08□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CBF1P17106 351 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W OCA4P25366 362 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CNS1P33313 385 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PXA2P34230 853 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W VHC1P38329 1120 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W IML2P47031 731 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W THI21Q08975 551 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W NUR1Q12066 484 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data7.07□□□□□ -1.28not detected
YLL058WYLL058W SPE1P08432 466 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SLY1P22213 666 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W DSS4P32601 143 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MRPL40P36534 297 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YBP1P38315 674 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MSC7P38694 644 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W LYS9P38999 446 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ARG2P40360 574 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YGL140CP53120 1219 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ALG12P53730 551 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ARA2Q04212 335 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PNP1Q05788 311 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W LCB4Q12246 624 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W IZH4Q99393 312 aa7.07□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W HSF1P10961 833 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W KGD2P19262 463 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SEC14P24280 304 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W DAL1P32375 460 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SFA1P32771 386 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W HSP78P33416 811 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W NUP120P35729 1037 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YBR225WP38321 900 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W STB5P38699 743 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W HSE1P38753 452 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SAK1P38990 1142 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RIO2P40160 425 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SAP185P40856 1058 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W ARP7Q12406 477 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YKL068W-AQ3E826 78 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa7.06□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CDC8P00572 216 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MPH2P0CD99 609 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W MET16P18408 261 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W PTH2P34222 208 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SET3P36124 751 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YKR051WP36142 418 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W DUG2P38149 878 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W CNN1P43618 361 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YGR127WP53275 312 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YNL034WP53963 612 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W YNL018CP53976 612 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data7.05□□□□□ -1.28not detected
YLL058WYLL058W KRE28Q04431 385 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W SFH1Q06168 426 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W FMP25Q08023 583 aa7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YLL058WYLL058W RRD2Q12461 358 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17 ms