RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	POL3	P15436	1097 aa		5.5	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	XBP1	P40489	647 aa		5.5	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	AIM6	Q07716	390 aa		5.5	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	ICL2	Q12031	575 aa		5.5	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	CAB2	P40506	365 aa		5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	CYK3	Q07533	885 aa		5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YDL242W	Q07746	117 aa		5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	MSS18	P08593	268 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	PTP1	P25044	335 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	SAE2	P46946	345 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YJR008W	P47085	338 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	ARA2	Q04212	335 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	PLM2	Q04383	521 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	HRD3	Q05787	833 aa		5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	PIF1	P07271	859 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	SIR1	P21691	654 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	GSY2	P27472	705 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	SIP1	P32578	815 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YNL058C	P53947	316 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	ATG21	Q02887	496 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	YOR389W	Q08912	624 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	FRE7	Q12333	620 aa		5.47	□□□□□ -1.53
OMA1	YKR087C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	MBR1	P23493	339 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RIT1	P23796	513 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	BEM3	P32873	1128 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	YHL041W	P38730	149 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	VPS8	P39702	1274 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	BSP1	Q06604	576 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	LCB4	Q12246	624 aa		5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PHO81	P17442	1178 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SWC3	P31376	625 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	CIR1	P42940	261 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	BST1	P43571	1029 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	TPO3	Q06451	622 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RTC1	Q08281	1341 aa		5.45	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PDE1	P22434	369 aa		5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RAD26	P40352	1085 aa		5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	NMD5	P46970	1048 aa		5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	NET1	P47035	1189 aa		5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	IOC4	Q04213	475 aa		5.44	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	LTP1	P40347	161 aa		5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	AFT2	Q08957	416 aa		5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.43	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SPC72	P39723	622 aa		5.42	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SKP2	P42843	763 aa		5.42	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SNO3	P43544	222 aa		5.42	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	YLR111W	Q12528	110 aa		5.42	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.41	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PET122	P10355	254 aa		5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	CLB4	P24871	460 aa		5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	FTH1	P38310	465 aa		5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	RSC9	Q03124	581 aa		5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.4	□□□□□ -1.54
OMA1	YKR087C	IRC7	P43623	340 aa		5.39	□□□□□ -1.55
OMA1	YKR087C	UBX6	P47049	396 aa		5.39	□□□□□ -1.55
OMA1	YKR087C	NPA3	P47122	385 aa		5.39	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.2 ms