RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	STU2	P46675	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YIP4	P53093	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	ACS1	Q01574	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	HOF1	Q05080	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	STB5	P38699	743 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VFA1	P40080	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	TRS31	Q03337	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	CRD1	Q07560	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	AAD4	Q07747	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	BET2	P20133	325 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	CNE1	P27825	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	YMC2	P38087	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	ACA1	P39970	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	BUD17	P53727	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	ENT2	Q05785	613 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PDR11	P40550	1411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PHO5	P00635	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	CTT1	P06115	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VPS34	P22543	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PTH2	P34222	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	LOT5	P34234	306 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	CCL1	P37366	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	TDP1	P38319	544 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PIH1	P38768	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MIT1	P40002	666 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	POL31	P46957	487 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	IDS2	P46958	469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	COS12	P53053	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	USA1	Q03714	838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	ATG16	Q03818	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	VPS64	Q03944	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	TGS1	Q12052	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
MTD1	YKR080W	SIR1	P21691	654 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MUP3	P38734	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	SPC72	P39723	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	GCN2	P15442	1659 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	TPK2	P06245	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	POL3	P15436	1097 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	STE12	P13574	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MSM1	P22438	575 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	EMP70	P32802	667 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	FUI1	P38196	639 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	SDH8	P38345	138 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	IES5	P40060	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTD1	YKR080W	NUP192	P47054	1683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	DBF20	P32328	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YIL166C	P40445	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	CAB2	P40506	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	COQ6	P53318	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	ARA2	Q04212	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	RPN13	O13563	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	SPO11	P23179	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	RIT1	P23796	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	CDC5	P32562	705 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YEL020C	P39994	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	SAP185	P40856	1058 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	SAP4	P53036	818 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YGL117W	P53133	265 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	CPR8	P53728	308 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	SUT2	Q12286	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	WHI2	P12611	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YCR061W	P25639	631 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	YPT10	P38146	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MTD1	YKR080W	LNP1	P38878	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.6 ms