RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W SGF29P25554 259 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YUR1P26725 428 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FLO10P36170 1169 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CDS1P38221 457 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TDP1P38319 544 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SFB3P38810 929 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
RTT105YER104W YJR061WP40355 935 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W POL31P46957 487 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YDL183CP48569 320 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W MUP1P50276 574 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FDC1Q03034 503 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TRS31Q03337 283 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RCF1Q03713 159 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W GAD1Q04792 585 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W COX17Q12287 69 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ECM3Q99252 613 aa3.38□□□□□ -1.87
RTT105YER104W GCN4P03069 281 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SEC12P11655 471 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PEX1P24004 1043 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YBR225WP38321 900 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W FTR1P40088 404 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W LYS14P40971 790 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.37□□□□□ -1.87not detected
RTT105YER104W GPD2P41911 440 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CIR1P42940 261 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SIP4P46954 829 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RCO1Q04779 684 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W THI7Q05998 598 aa3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YLR302CO13544 120 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CTT1P06115 562 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PET122P10355 254 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RED1P14291 827 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SPO16P17122 198 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SWC3P31376 625 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ESL2P36168 1195 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W NPR2P39923 615 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W GET2P40056 285 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YIR042CP40586 236 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YJL163CP46996 555 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W MFB1Q04922 465 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W THI22Q06490 572 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VAM6Q07468 1049 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W AIM6Q07716 390 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W HUA2Q12134 243 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SFI1Q12369 946 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PCD1Q12524 340 aa3.36□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SEC53P07283 254 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-FP0CX61 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W CKA1P15790 372 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TUP1P16649 713 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-CP25383 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W MRP20P32387 263 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YBR053CP38235 358 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W APE4P38821 490 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W AXL1P40851 1208 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RMD8P43620 662 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ZAP1P47043 880 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YML6P51998 286 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VPS4P52917 437 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W COG1P53079 417 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RIA1P53893 1110 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-DR2Q03483 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ICL2Q12031 575 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-BQ12260 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-OR2Q12293 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SUL2Q12325 893 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-DR1Q12392 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-OR1Q12439 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YOR111WQ99210 232 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W TY2A-DR3Q99303 438 aa3.35□□□□□ -1.87
RTT105YER104W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms