RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C EMP65P40085 556 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BIR1P47134 954 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PEF1P53238 335 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SHE9Q04172 456 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SPC2Q04969 178 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YLR287CQ05881 355 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPS36Q06696 566 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GRC3Q07845 632 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TRE1Q08919 783 aa3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-BRQ12193 1756 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TY1B-ORQ92393 1755 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
DOA4YDR069C RAD1P06777 1100 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HOM3P10869 527 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RAD4P14736 754 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C URA4P20051 364 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ATP12P22135 325 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CLB2P24869 491 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RDS1P25611 832 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ZIP1P31111 875 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MDL2P33311 773 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MRPL17P36528 281 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CCZ1P38273 704 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RAD17P48581 401 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C APT1P49435 187 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SPO1P53541 631 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RRN5Q02983 363 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPN4Q03465 531 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NSE5Q03718 556 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FIN1Q03898 291 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FMP42Q04991 504 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C INH1P01097 85 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SIN4P32259 974 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DOA4P32571 926 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LRG1P35688 1017 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YBR184WP38299 523 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RCY1P39531 840 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SEN34P39707 275 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GEM1P39722 662 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPH1P39956 796 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RTT105P40063 208 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RIC1P40395 1056 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YJL055WP47044 245 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HFM1P51979 1187 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ERO1Q03103 563 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ABZ2Q03266 374 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
DOA4YDR069C SDH5Q08230 162 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MED7Q08278 222 aa3.26□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MATALPHA2P0CY08 210 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SRO9P25567 434 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRO1P32264 428 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YBL010CP32788 280 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PXL1P36166 706 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89 RIP-Chip
DOA4YDR069C OCA5P38738 679 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AGE2P40529 298 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C GTS1P40956 396 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C EPL1P43572 832 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RET2P43621 546 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BSC5P53755 489 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CWC25P53854 179 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MUB1Q03162 620 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DXO1Q06349 442 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YDL114WQ07530 308 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NSE1Q07913 336 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YOL057WQ08225 711 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DAS2Q12084 232 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RMP1Q12530 201 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YLR278CQ05854 1341 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C STE12P13574 688 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
DOA4YDR069C ADP1P25371 1049 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C APL1P27351 700 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C EUG1P32474 517 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPS21P36017 210 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TDA3P38758 523 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PTC7P38797 343 aa3.25□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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