RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm1968Q3T9I3 115 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm26938S4R185 226 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rif1Q6PR54 2419 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8439G3UWA7 96 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01802 115 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tex26Q0VB26 296 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rbfox3Q8BIF2 374 aa14.8□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo18bE9PV66 2605 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav9-2A0A075B647 113 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv2-3A0A075B696 115 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr869E9PX82 323 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacng7P62956 275 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2-DMb2Q31099 261 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dusp14Q9JLY7 198 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rabac1Q9Z0S9 185 aa14.79□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map1lc3aQ91VR7 121 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrpl36Q99N90 102 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2al2bA9Z055 111 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Srp14P16254 110 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SstP60041 116 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5150Q1AN92 299 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klk7Q91VE3 249 aa14.78□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 S100a4P07091 101 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5464Q3UY29 175 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpx7Q99LJ6 186 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gkn1Q9CR36 201 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ube2cQ9D1C1 179 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Card19Q9D1I2 183 aa14.77□□□□□ -0.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa14.77□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm6040Q4QY32 63 aa14.77□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndufb4Q9CQC7 129 aa14.77□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm26661M0QWV4 156 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd69P37217 199 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defb26Q30KN7 186 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Khdc1cQ4KL78 166 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ang6Q5GAN0 147 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ucn2Q99ML8 113 aa14.76□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A0A1Y7VMQ4 148 aa14.75□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klf13Q9JJZ6 289 aa14.75□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa14.75□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa14.75□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgap32Q811P8 2089 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav14-2A0A075B694 121 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm20458E9PXJ7 78 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MdfiP70331 251 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam216aQ9DB54 251 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BsnO88737 3942 aa14.74□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fhl2O70433 279 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnf183Q8QZS5 190 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erdr1J3QMM0 206 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnase1P00683 149 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P06328 117 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nf1Q04690 2841 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smim15Q3UTD9 74 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr322Q5NCC8 327 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r216Q8R257 298 aa14.73□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trbv14A0A140T8L9 115 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1810032O08RikE9PZV8 113 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uqcc3Q8K2T4 89 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem14cQ9CQN6 114 aa14.72□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thy1P01831 162 aa14.71□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lcn2P11672 200 aa14.71□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Avpi1Q9D7H4 142 aa14.71□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atg101Q9D8Z6 218 aa14.71□□□□□ -0.05
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmb8P28063 276 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fxyd7P59648 80 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TctaQ8VEA7 122 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CubnQ9JLB4 3623 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa14.7□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tenm3Q9WTS6 2715 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdx4Q07424 282 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem136Q3TYE7 245 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il22ra1Q80XZ4 581 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zmat5Q9CQR5 170 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sertad4A7DTG3 377 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2-DMb1P35737 261 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1367Q8VFG2 316 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lamtor2Q9JHS3 125 aa14.69□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm29666A0A087WQ99 126 aa14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm28305F6U473 122 aa14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P06330 118 aa14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmg4P0C7N9 123 aa14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dkk2Q9QYZ8 259 aa14.68□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Reg3gO09049 174 aa14.67□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps12O35680 139 aa14.67□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Runx1Q03347 451 aa14.67□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q3UNZ8 350 aa14.67□□□□□ -0.06
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tomm6Q9CQN3 74 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.4 ms