Protein–RNA interactions for Protein: P01831

Thy1, Thy-1 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thy1P01831 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Thy1P01831 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thy1P01831 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thy1P01831 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thy1P01831 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thy1P01831 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thy1P01831 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thy1P01831 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Thy1P01831 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thy1P01831 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Thy1P01831 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Thy1P01831 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Thy1P01831 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thy1P01831 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thy1P01831 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Thy1P01831 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thy1P01831 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Thy1P01831 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thy1P01831 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thy1P01831 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thy1P01831 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thy1P01831 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thy1P01831 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thy1P01831 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thy1P01831 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thy1P01831 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thy1P01831 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Thy1P01831 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thy1P01831 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thy1P01831 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thy1P01831 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thy1P01831 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thy1P01831 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thy1P01831 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thy1P01831 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thy1P01831 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thy1P01831 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thy1P01831 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Thy1P01831 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thy1P01831 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thy1P01831 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thy1P01831 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thy1P01831 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thy1P01831 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thy1P01831 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thy1P01831 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thy1P01831 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Thy1P01831 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thy1P01831 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thy1P01831 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thy1P01831 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thy1P01831 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thy1P01831 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thy1P01831 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thy1P01831 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thy1P01831 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thy1P01831 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thy1P01831 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thy1P01831 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thy1P01831 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thy1P01831 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Thy1P01831 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thy1P01831 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Thy1P01831 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Thy1P01831 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thy1P01831 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thy1P01831 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thy1P01831 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Thy1P01831 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thy1P01831 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thy1P01831 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Thy1P01831 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Thy1P01831 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Thy1P01831 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Thy1P01831 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thy1P01831 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Thy1P01831 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Thy1P01831 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thy1P01831 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Thy1P01831 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thy1P01831 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Thy1P01831 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Thy1P01831 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Thy1P01831 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Thy1P01831 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Thy1P01831 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Thy1P01831 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Thy1P01831 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thy1P01831 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms