RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.65□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 MUC2Q02817 5179 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-203ENST00000460759 COA5Q86WW8 74 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-203ENST00000460759 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-203ENST00000460759 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.59□□□□□ -1.35
NISCH-203ENST00000460759 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.57□□□□□ -1.36
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.55□□□□□ -1.36
NISCH-203ENST00000460759 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.53□□□□□ -1.36
NISCH-203ENST00000460759 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.51□□□□□ -1.37
NISCH-203ENST00000460759 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.5□□□□□ -1.37
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.5□□□□□ -1.37
NISCH-203ENST00000460759 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.5□□□□□ -1.37
NISCH-203ENST00000460759 V9GYY9 64 aa6.46□□□□□ -1.38
NISCH-203ENST00000460759 S4R3F8 94 aa6.45□□□□□ -1.38
NISCH-203ENST00000460759 Q1T7F1 81 aa6.41□□□□□ -1.38
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-203ENST00000460759 LCA10Q71F78 164 aa6.38□□□□□ -1.39
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-203ENST00000460759 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-203ENST00000460759 CSAG1Q6PB30 78 aa6.32□□□□□ -1.4
NISCH-203ENST00000460759 PRR15LQ9BU68 103 aa6.32□□□□□ -1.4
NISCH-203ENST00000460759 SEC61GP60059 68 aa6.3□□□□□ -1.4
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.29□□□□□ -1.4
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GU69 56 aa6.28□□□□□ -1.4
NISCH-203ENST00000460759 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.26□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.24□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 H0YAA0 97 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 PSPHP1O15172 72 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-203ENST00000460759 Q5VV11 94 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-203ENST00000460759 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-203ENST00000460759 MT1HP80294 61 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 LCE3BQ5TA77 95 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 M0R2T5 61 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 UQCR11O14957 56 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GU33 70 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 A6NED7 52 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
NISCH-203ENST00000460759 P0C880 135 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-203ENST00000460759 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.01□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 M0QZ58 72 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 LCE4AQ5TA78 99 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.99□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 CRIPTQ9P021 101 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 BRK1Q8WUW1 75 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-203ENST00000460759 R4GN34 69 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 MT2AP02795 61 aa5.87□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 PRO0628Q9UI54 55 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP10-10P60014 251 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-203ENST00000460759 K7ERS5 55 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 MT1FP04733 61 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 A8MU10 97 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 A0A0D9SG42 100 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 A6NN06 94 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.76□□□□□ -1.49
NISCH-203ENST00000460759 LINC01554Q52M75 96 aa5.76□□□□□ -1.49
NISCH-203ENST00000460759 LCE1DQ5T752 114 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP12-1P59990 96 aa5.71□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 SSPOA2VEC9 5147 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 USH2AO75445 5202 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP12-2P59991 146 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 PMAIP1Q13794 54 aa5.65□□□□□ -1.5
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.64□□□□□ -1.51
NISCH-203ENST00000460759 PLAC4Q8WY50 150 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-203ENST00000460759 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.56□□□□□ -1.52
NISCH-203ENST00000460759 SVIPQ8NHG7 77 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-203ENST00000460759 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
NISCH-203ENST00000460759 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.53□□□□□ -1.52
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.53□□□□□ -1.52
NISCH-203ENST00000460759 MT1BP07438 61 aa5.52□□□□□ -1.53
NISCH-203ENST00000460759 ROMO1P60602 79 aa5.51□□□□□ -1.53
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-203ENST00000460759 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
NISCH-203ENST00000460759 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
NISCH-203ENST00000460759 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.44□□□□□ -1.54
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.41□□□□□ -1.54
NISCH-203ENST00000460759 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.4□□□□□ -1.54
NISCH-203ENST00000460759 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.38□□□□□ -1.55
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.36□□□□□ -1.55
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-203ENST00000460759 MT1XP80297 61 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP10-5P60370 271 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-203ENST00000460759 TNP1P09430 55 aa5.31□□□□□ -1.56
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.26□□□□□ -1.57
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