RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem262D3Z338 116 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm12169F2Z474 250 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm15056F6ZR08 88 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnase1P00683 149 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hoxa5P09021 270 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hist1h2bmP10854 126 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rps20P60867 119 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Defb26Q30KN7 186 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem241Q3UME2 297 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm16686Q3UMN9 131 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q3UUX7 111 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BC100530Q497J0 97 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem256Q5F285 113 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hist1h2bhQ64478 126 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hist2h2bbQ64525 126 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Il31Q6EAL8 163 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Olfr1437Q7TQR7 312 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf152Q8BG47 203 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 C130073F10RikQ8C4L8 201 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tctex1d4Q8CDY7 219 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trpt1Q8K3A2 249 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Defb10Q8R2I8 73 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Glrx2Q923X4 156 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rchy1Q9CR50 261 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lyg1Q9D7Q0 197 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vamp5Q9Z2P8 102 aa5.36□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfp979A2A799 407 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm9047B9EJX3 177 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 A930009A15RikG3UYI6 118 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm21887J3QQ04 176 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Saa3P04918 122 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Twist1P26687 206 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpm6bP35803 328 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm5150Q1AN92 299 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 SbsponQ3UPR9 264 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fa2hQ5MPP0 372 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CnfnQ6PCW6 111 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CdsnQ7TPC1 561 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vmn1r202Q8R259 302 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Klk7Q91VE3 249 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ucn2Q99ML8 113 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mpv17lQ99MS3 194 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 RhohQ9D3G9 191 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cbln1Q9R171 193 aa5.35□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm20379A0A087WR34 119 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 P01750 117 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Srp14P16254 110 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdx1P18111 268 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 H2-DMb2Q31099 261 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 A930003A15RikQ3U552 87 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Smim9Q3V0X1 137 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q4KKZ1 196 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trp53rkaQ5U452 244 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Foxc2Q61850 494 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vsig8Q6P3A4 417 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam222aQ6PGH4 453 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gphb5Q812B2 130 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Megf9Q8BH27 600 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nhlrc1Q8BR37 401 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Muc15Q8C6Z1 331 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cd99Q8VCN6 175 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tp53rkQ99PW4 244 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lyzl1Q9CPX3 148 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q9CR34 168 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nit2Q9JHW2 276 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dusp14Q9JLY7 198 aa5.34□□□□□ -1.55
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trav16nA0A075B634 117 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rhox7bA6PW38 321 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Scgb2a2J3KMP9 96 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm10251J3QPM5 127 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fhl2O70433 279 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PigyP0C1P0 71 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pex7P97865 318 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AsipQ03288 131 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MymxQ2Q5T5 84 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fbxl7Q5BJ29 491 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc17a2Q5SZA1 478 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pafah1b2Q61206 229 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem140Q8BGY5 185 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wfdc15aQ8BH89 80 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rasl10aQ8K5A4 203 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm2916Q9D9B9 127 aa5.33□□□□□ -1.56
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.3 ms