RNA–Protein interactions for RNA: YMR033W

ARP9, Transcript of Component of both the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes, yeast

Gene ARP9, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP9	YMR033W	TAF3	Q12297	353 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	STE4	P18851	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	VPS34	P22543	875 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	CNE1	P27825	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PIH1	P38768	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PMT6	P42934	759 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	COS12	P53053	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ARA2	Q04212	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	TMN2	Q04562	672 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	MTH1	P35198	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	CCL1	P37366	393 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	CAB2	P40506	365 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ERR3	P42222	437 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	BUD17	P53727	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	TGS1	Q12052	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	RIT1	P23796	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	CLB4	P24871	460 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	LOT5	P34234	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PUG1	P40100	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	USA1	Q03714	838 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	CIA1	Q05583	330 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	NUC1	P08466	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	YMC2	P38087	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	EXO84	P38261	753 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ATG21	Q02887	496 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	SSM4	P40318	1319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	SDH8	P38345	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	PSF2	P40359	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	STU2	P46675	888 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	AIM6	Q07716	390 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	IRC10	Q08118	586 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	ICL2	Q12031	575 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARP9	YMR033W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YCL049C	P25577	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	CDC5	P32562	705 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	XRS2	P33301	854 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	MRPL36	P36531	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YBR138C	P38277	524 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	LNP1	P38878	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	MIT1	P40002	666 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SMK1	P41808	388 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	IML2	P47031	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	IMA1	P53051	589 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	TPK2	P06245	380 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YCR061W	P25639	631 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SWC3	P31376	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	BEM3	P32873	1128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	PSY4	P38193	441 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	COQ6	P53318	479 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	GTR1	Q00582	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YML131W	Q03102	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	CRF1	Q04930	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	MTF2	P10849	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	BIK1	P11709	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	WHI2	P12611	486 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	STE12	P13574	688 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YPT10	P38146	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	TDP1	P38319	544 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	MUP3	P38734	546 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	NPR3	P38742	1146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SAP4	P53036	818 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	CPR8	P53728	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
ARP9	YMR033W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	AAC1	P04710	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SSH4	P32343	579 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	YGL117W	P53133	265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	SUL2	Q12325	893 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	RPN13	O13563	156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ARP9	YMR033W	PET122	P10355	254 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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