RNA–Protein interactions for RNA: YML047W-A

YML047W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YML047W-A, Length 366 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YML047W-A	YML047W-A	TRS130	Q03660	1102 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	USA1	Q03714	838 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	HOF1	Q05080	669 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	SSM4	P40318	1319 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	MTF2	P10849	440 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	BET2	P20133	325 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	RIT1	P23796	513 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	CNE1	P27825	502 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	BEM3	P32873	1128 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	OAR1	P35731	278 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	PSY4	P38193	441 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	NPR3	P38742	1146 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	IML2	P47031	731 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	YIP4	P53093	235 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	GTR1	Q00582	310 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	ATG21	Q02887	496 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	AIM6	Q07716	390 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	TAF3	Q12297	353 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	LAM4	P38800	1345 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YML047W-A	YML047W-A	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	NUC1	P08466	329 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	BIK1	P11709	440 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	STE4	P18851	423 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SSH4	P32343	579 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CCL1	P37366	393 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MOH1	P38191	138 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YBR138C	P38277	524 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YJL206C	P39529	758 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SDS3	P40505	327 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SMK1	P41808	388 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SLI1	P53304	468 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SPC98	P53540	846 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YDL121C	Q07541	149 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	TGS1	Q12052	315 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	NKP1	Q12493	238 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	KIN3	P22209	435 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	LOT5	P34234	306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MRPL36	P36531	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	PIH1	P38768	344 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.39	□□□□□ -1.71	not detected
YML047W-A	YML047W-A	PSF2	P40359	213 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	PMT6	P42934	759 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	BUD17	P53727	317 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	ICL2	Q12031	575 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	PNS1	Q12412	539 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CDC43	P18898	376 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	DMC1	P25453	334 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YCR061W	P25639	631 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SDH8	P38345	138 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	RAD26	P40352	1085 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	BST1	P43571	1029 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	VPS72	Q03388	795 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	TRS23	Q03784	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YDL073W	Q07454	984 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SWC3	P31376	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CDC5	P32562	705 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YMC2	P38087	329 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	VID27	P40157	782 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	GND2	P53319	492 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	TMN2	Q04562	672 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SSP2	Q08646	371 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	AAC1	P04710	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	YPT10	P38146	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	TFC6	Q06339	672 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	OPY2	Q06810	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SUL2	Q12325	893 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	PET122	P10355	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	WHI2	P12611	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	RER1	P25560	188 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MTH1	P35198	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	RRN3	P36070	627 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	MIT1	P40002	666 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CTF18	P49956	741 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	SAP4	P53036	818 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	COQ6	P53318	479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CPR8	P53728	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CRF1	Q04930	467 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YML047W-A	YML047W-A	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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