RNA–Protein interactions for RNA: YJR136C

TTI2, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI2, Length 1,266 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI2	YJR136C	VPS64	Q03944	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MLH3	Q12083	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TTI2	YJR136C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	VPS33	P20795	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	KIN3	P22209	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MCM10	P32354	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	GLG1	P36143	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YJL193W	P39542	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	VFA1	P40080	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ATG21	Q02887	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	BIK1	P11709	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	CTP1	P38152	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	CDS1	P38221	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MNT3	P40549	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ENT2	Q05785	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TAF3	Q12297	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	RTP1	Q12751	981 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TUP1	P16649	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	RIT1	P23796	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	JNM1	P36224	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YJL206C	P39529	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	BDH2	P39713	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MPS3	P47069	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YDL183C	P48569	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TRS31	Q03337	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	USV1	Q12132	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	VPS34	P22543	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	IMP2'	P32351	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	LRO1	P40345	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	POL31	P46957	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	RFX1	P48743	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	CTF18	P49956	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YGR151C	P53287	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
TTI2	YJR136C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	FUB1	P25659	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	DSS4	P32601	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	GMH1	P36125	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TMN3	P40071	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	KHA1	P40309	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	IDS2	P46958	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ACS1	Q01574	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	VID22	Q05934	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTI2	YJR136C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	BET2	P20133	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NUP120	P35729	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	APL3	P38065	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	EHT1	P38295	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	THI6	P41835	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	BST1	P43571	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MEP3	P53390	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	NBP2	Q12163	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	CNS1	P33313	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SET3	P36124	751 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YBR138C	P38277	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SKP2	P42843	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SRB7	P47822	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	ARR3	Q06598	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	AIM6	Q07716	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	IZH3	Q07959	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	INH1	P01097	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TPK1	P06244	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	PET122	P10355	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	UBS1	P38290	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YER010C	P40011	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YIL166C	P40445	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	TIM50	Q02776	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	RPN13	O13563	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTI2	YJR136C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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