RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C SMF1P38925 575 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C BUD16P39988 312 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C ATF1P40353 525 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C MET18P40469 1032 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C RRT14P40470 206 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C CAB2P40506 365 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C NAS2P40555 220 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C GCD10P41814 478 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C HFM1P51979 1187 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C EXG2P52911 562 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C TEL2P53038 688 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C MNP1P53163 194 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C YNR068CP53754 272 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C HOS1Q12214 470 aa6.9□□□□□ -1.3
SHO1YER118C YRF1-4O13559 1382 aa6.9□□□□□ -1.31
SHO1YER118C URA3P03962 267 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CMP2P14747 604 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CLB3P24870 427 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CWH43P25618 953 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C RSC6P25632 483 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C EFT1P32324 842 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C NIP1P32497 812 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SSE1P32589 693 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SRO77P38163 1010 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data6.89□□□□□ -1.31 RIP-Chip
SHO1YER118C PEF1P53238 335 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SNF12P53628 566 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YAP6Q03935 383 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C RAD30Q04049 632 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SKG3Q06315 1026 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PHO92Q06390 306 aa6.89□□□□□ -1.31
SHO1YER118C OM45P16547 393 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SWC3P31376 625 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C LOT5P34234 306 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C NNK1P36003 928 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YEL057CP39983 233 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C EFM4P40516 257 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C IST3P40565 148 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C COG1P53079 417 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PUS2P53167 370 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CUL3P53202 744 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C LSC2P53312 427 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ORC4P54791 529 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C GTB1Q04924 702 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ELG1Q12050 791 aa6.88□□□□□ -1.31
SHO1YER118C LAT1P12695 482 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ERS1P17261 260 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PRE8P23639 250 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C URA7P28274 579 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C MSP1P28737 362 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YSC84P32793 468 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C MIC60P36112 540 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C APN2P38207 520 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YHR033WP38690 423 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C MTG2P38860 518 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SPO1P53541 631 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C DUS1P53759 423 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C MGR3Q04472 501 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YPR172WQ06608 200 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SPE3Q12074 293 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C OSW2Q12202 724 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PSY3Q12318 242 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C GPM3Q12326 303 aa6.87□□□□□ -1.31
SHO1YER118C AFT1P22149 690 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YCR051WP25631 222 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C RPD3P32561 433 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C YEL043WP32618 956 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C NIP100P33420 868 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C GIP2P40036 548 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C OSW5P40219 148 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C BUD8P41698 603 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C FET5P43561 622 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C NCE103P53615 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PRO2P54885 456 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C REG1Q00816 1014 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C GCR2Q01722 534 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ATG21Q02887 496 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C FMP45Q07651 309 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C RIM20Q12033 661 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C MDY2Q12285 212 aa6.86□□□□□ -1.31
SHO1YER118C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C TY2A-FP0CX61 438 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C TY2A-GR2P0CX62 438 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C STE12P13574 688 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C IME1P21190 360 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C ARG1P22768 420 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C TY2A-CP25383 438 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C RAD51P25454 400 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C SUR1P33300 382 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C UBP11P36026 717 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C HEL1P36113 551 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C PCH2P38126 564 aa6.85□□□□□ -1.31
SHO1YER118C UBP13P38187 747 aa6.85□□□□□ -1.31
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