RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	ARR3	Q06598	404 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PSF3	Q12146	194 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YSP3	P25036	478 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	BUD14	P27637	709 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPD3	P32561	433 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GYP6	P32806	458 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RIB7	P33312	244 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SRO77	P38163	1010 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YSW1	P38280	609 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	BIO3	P50277	480 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YMR187C	Q03236	431 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RRD2	Q12461	358 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SWC3	P31376	625 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SEC66	P33754	206 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MAC1	P35192	417 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YAR028W	P39548	234 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	EFM4	P40516	257 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YJL045W	P47052	634 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YDR514C	Q04408	483 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ENT4	Q07872	247 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	FRE6	Q12473	712 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PHO5	P00635	467 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	APN1	P22936	367 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CLB4	P24871	460 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SLC1	P33333	303 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SWH1	P35845	1188 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ALG14	P38242	237 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GIP2	P40036	548 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YER158C	P40095	573 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	STU2	P46675	888 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YGR266W	P53326	701 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ECM18	Q04623	453 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MCH5	Q08777	521 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
AI2	Q0055	PCL7	P40186	285 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	GSM1	P42950	618 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YKR011C	Q02209	353 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RCO1	Q04779	684 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RSF1	Q05043	376 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TDA6	Q06466	467 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	CDA1	Q06702	301 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ENT1	Q12518	454 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TPK1	P06244	397 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RIT1	P23796	513 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PGS1	P25578	521 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	IME2	P32581	645 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YSC84	P32793	468 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SUR1	P33300	382 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YBR139W	P38109	508 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RTS1	P38903	757 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MLH1	P38920	769 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	POP2	P39008	433 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SER3	P40054	469 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	OSW5	P40219	148 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	AAD10	P47182	288 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	MRPS35	P53292	345 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TOF2	Q02208	771 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PEX25	Q02969	394 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	PHO92	Q06390	306 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SVS1	Q12254	260 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NUC1	P08466	329 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	SYN8	P31377	255 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	TAF5	P38129	798 aa		2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
AI2	Q0055	ARP1	P38696	384 aa		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms