RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 MSH5O43196 834 aa16.17■□□□□ 0.18
CU633980.1-201ENST00000613894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.17■□□□□ 0.18
CU633980.1-201ENST00000613894 FKBP8Q14318 412 aa16.16■□□□□ 0.18
CU633980.1-201ENST00000613894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CU633980.1-201ENST00000613894 NEFLP07196 543 aa16.14■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 CLIP1P30622 1438 aa16.11■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 PRDM2Q13029 1718 aa16.09■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 ARAP1Q96P48 1450 aa16.09■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 BCANQ96GW7 911 aa16.08■□□□□ 0.17
CU633980.1-201ENST00000613894 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CU633980.1-201ENST00000613894 TOPBP1Q92547 1522 aa16.07■□□□□ 0.16
CU633980.1-201ENST00000613894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CU633980.1-201ENST00000613894 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.05■□□□□ 0.16
CU633980.1-201ENST00000613894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.04■□□□□ 0.16
CU633980.1-201ENST00000613894 CCER2I3L3R5 266 aa16.02■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 CHD1O14646 1710 aa16.01■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 KCNH8Q96L42 1107 aa15.97■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.96■□□□□ 0.15
CU633980.1-201ENST00000613894 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CU633980.1-201ENST00000613894 FBLN2P98095 1184 aa15.92■□□□□ 0.14
CU633980.1-201ENST00000613894 MAPKBP1O60336 1514 aa15.89■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.88■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 ITGAEP38570 1179 aa15.87■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 SYNJ1O43426 1573 aa15.83■□□□□ 0.13
CU633980.1-201ENST00000613894 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.82■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.8■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.8■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 WDR97A6NE52 1622 aa15.8■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.79■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.79■□□□□ 0.12
CU633980.1-201ENST00000613894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 ANP32CO43423 234 aa15.77■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.77■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.76■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.74■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.72■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 TRIM52Q96A61 297 aa15.71■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 SYNJ2O15056 1496 aa15.71■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 GRIN2BQ13224 1484 aa15.71■□□□□ 0.11
CU633980.1-201ENST00000613894 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.7■□□□□ 0.1
CU633980.1-201ENST00000613894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.69■□□□□ 0.1
CU633980.1-201ENST00000613894 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CU633980.1-201ENST00000613894 MAP3K1Q13233 1512 aa15.68■□□□□ 0.1
CU633980.1-201ENST00000613894 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.66■□□□□ 0.1
CU633980.1-201ENST00000613894 PRXQ9BXM0 1461 aa15.64■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 CUX1P39880 1505 aa15.61■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.6■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 TOP2BQ02880 1626 aa15.59■□□□□ 0.09
CU633980.1-201ENST00000613894 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.57■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 PBRM1Q86U86 1689 aa15.57■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.56■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 NBR1Q14596 966 aa15.55■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 USP35Q9P2H5 1018 aa15.54■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 TIAM1Q13009 1591 aa15.53■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.52■□□□□ 0.08
CU633980.1-201ENST00000613894 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.52■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.52■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.51■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 IL27Q8NEV9 243 aa15.51■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 GRIN2AQ12879 1464 aa15.51■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 CEP170Q5SW79 1584 aa15.5■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 NUP160Q12769 1436 aa15.5■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.5■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 NCOA2Q15596 1464 aa15.49■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.48■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.47■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.47■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 SHROOM2Q13796 1616 aa15.47■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.46■□□□□ 0.07
CU633980.1-201ENST00000613894 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.45■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.44■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.42■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 ADAMTS12P58397 1594 aa15.42■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.42■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.41■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CU633980.1-201ENST00000613894 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms