RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594581.5

STRN4-208, Transcript of striatin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STRN4, Length 2,692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4-208ENST00000594581 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.67■■□□□ 1.7
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STRN4-208ENST00000594581 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.61■■□□□ 1.69
STRN4-208ENST00000594581 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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STRN4-208ENST00000594581 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.51■■□□□ 1.67
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STRN4-208ENST00000594581 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.48■■□□□ 1.67
STRN4-208ENST00000594581 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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STRN4-208ENST00000594581 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.4■■□□□ 1.66
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STRN4-208ENST00000594581 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.38■■□□□ 1.65
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STRN4-208ENST00000594581 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.34■■□□□ 1.65
STRN4-208ENST00000594581 BCL11AQ9H165 835 aa25.32■■□□□ 1.64
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STRN4-208ENST00000594581 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.647e-8■■■■■ 35.1
STRN4-208ENST00000594581 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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STRN4-208ENST00000594581 ANP32CO43423 234 aa25.26■■□□□ 1.63
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STRN4-208ENST00000594581 CCER2I3L3R5 266 aa25.24■■□□□ 1.63
STRN4-208ENST00000594581 TOPBP1Q92547 1522 aa25.24■■□□□ 1.63
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STRN4-208ENST00000594581 FMN1Q68DA7 1419 aa25.19■■□□□ 1.62
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STRN4-208ENST00000594581 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.18■■□□□ 1.62
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STRN4-208ENST00000594581 CUL7Q14999 1698 aa25.16■■□□□ 1.62
STRN4-208ENST00000594581 HFM1A2PYH4 1435 aa25.15■■□□□ 1.62
STRN4-208ENST00000594581 UACAQ9BZF9 1416 aa25.15■■□□□ 1.62
STRN4-208ENST00000594581 NEFLP07196 543 aa25.13■■□□□ 1.61
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STRN4-208ENST00000594581 NAIPQ13075 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
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STRN4-208ENST00000594581 GRIN2BQ13224 1484 aa25.03■■□□□ 1.6
STRN4-208ENST00000594581 SAMD9Q5K651 1589 aa25.02■■□□□ 1.6
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STRN4-208ENST00000594581 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.93■■□□□ 1.58
STRN4-208ENST00000594581 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.93■■□□□ 1.58
STRN4-208ENST00000594581 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.92■■□□□ 1.58
STRN4-208ENST00000594581 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.91■■□□□ 1.58
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STRN4-208ENST00000594581 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
STRN4-208ENST00000594581 KDM6BO15054 1643 aa24.84■■□□□ 1.57
STRN4-208ENST00000594581 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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STRN4-208ENST00000594581 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.8■■□□□ 1.56
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STRN4-208ENST00000594581 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.79■■□□□ 1.56
STRN4-208ENST00000594581 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
STRN4-208ENST00000594581 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
STRN4-208ENST00000594581 HECW1Q76N89 1606 aa24.77■■□□□ 1.56
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STRN4-208ENST00000594581 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
STRN4-208ENST00000594581 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
STRN4-208ENST00000594581 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.72■■□□□ 1.55
STRN4-208ENST00000594581 AKNAQ7Z591 1439 aa24.72■■□□□ 1.55
STRN4-208ENST00000594581 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.71■■□□□ 1.55
STRN4-208ENST00000594581 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.7■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 MSH5O43196 834 aa24.7■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.68■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 CCDC7Q96M83 1385 aa24.68■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 MIA2Q96PC5 1412 aa24.67■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
STRN4-208ENST00000594581 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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