RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.25■■□□□ 1.31
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CCDC130-211ENST00000589669 FBLN2P98095 1184 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC130-211ENST00000589669 WDR97A6NE52 1622 aa23.11■■□□□ 1.29
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CCDC130-211ENST00000589669 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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CCDC130-211ENST00000589669 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
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CCDC130-211ENST00000589669 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC130-211ENST00000589669 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC130-211ENST00000589669 TOP2BQ02880 1626 aa23■■□□□ 1.27
CCDC130-211ENST00000589669 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 SYNJ1O43426 1573 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 CHD1O14646 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 SYNJ2O15056 1496 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 ARHGEF11O15085 1522 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC130-211ENST00000589669 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC130-211ENST00000589669 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC130-211ENST00000589669 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC130-211ENST00000589669 PBRM1Q86U86 1689 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC130-211ENST00000589669 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC130-211ENST00000589669 POLA2Q14181 598 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC130-211ENST00000589669 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC130-211ENST00000589669 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC130-211ENST00000589669 ABCB7O75027 752 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC130-211ENST00000589669 GRIN2AQ12879 1464 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC130-211ENST00000589669 ARAP1Q96P48 1450 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC130-211ENST00000589669 ADAMTS12P58397 1594 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC130-211ENST00000589669 NUP160Q12769 1436 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC130-211ENST00000589669 DSG3P32926 999 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC130-211ENST00000589669 IGF1RP08069 1367 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC130-211ENST00000589669 KIF27Q86VH2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC130-211ENST00000589669 CEP170Q5SW79 1584 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC130-211ENST00000589669 JPH4Q96JJ6 628 aa22.56■■□□□ 1.2
CCDC130-211ENST00000589669 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCDC130-211ENST00000589669 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.48■■□□□ 1.19
CCDC130-211ENST00000589669 FKBP8Q14318 412 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC130-211ENST00000589669 SHROOM2Q13796 1616 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC130-211ENST00000589669 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.45■■□□□ 1.18
CCDC130-211ENST00000589669 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCDC130-211ENST00000589669 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC130-211ENST00000589669 CUL7Q14999 1698 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC130-211ENST00000589669 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC130-211ENST00000589669 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.34■■□□□ 1.17
CCDC130-211ENST00000589669 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC130-211ENST00000589669 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC130-211ENST00000589669 PTPRGP23470 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC130-211ENST00000589669 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC130-211ENST00000589669 IQGAP2Q13576 1575 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC130-211ENST00000589669 PRXQ9BXM0 1461 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC130-211ENST00000589669 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC130-211ENST00000589669 DISP1Q96F81 1524 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC130-211ENST00000589669 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.07■■□□□ 1.12
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CCDC130-211ENST00000589669 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.04■■□□□ 1.12
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CCDC130-211ENST00000589669 EEA1Q15075 1411 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC130-211ENST00000589669 MAPKBP1O60336 1514 aa22.01■■□□□ 1.11
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CCDC130-211ENST00000589669 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.99■■□□□ 1.11
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CCDC130-211ENST00000589669 KIAA0556O60303 1618 aa21.91■■□□□ 1.1
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CCDC130-211ENST00000589669 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.85■■□□□ 1.09
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CCDC130-211ENST00000589669 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC130-211ENST00000589669 DIP2BQ9P265 1576 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC130-211ENST00000589669 PROM2Q8N271 834 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC130-211ENST00000589669 P3H3Q8IVL6 736 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC130-211ENST00000589669 ABCA8O94911 1581 aa21.75■■□□□ 1.07
CCDC130-211ENST00000589669 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.74■■□□□ 1.07
CCDC130-211ENST00000589669 GLI2P10070 1586 aa21.74■■□□□ 1.07
CCDC130-211ENST00000589669 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCDC130-211ENST00000589669 KIF21BO75037 1637 aa21.7■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 SAMD9Q5K651 1589 aa21.69■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.67■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 KCNH8Q96L42 1107 aa21.66■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 ATP10BO94823 1461 aa21.65■■□□□ 1.06
CCDC130-211ENST00000589669 ARID3CA6NKF2 412 aa21.61■■□□□ 1.05
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