RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ITGA3-216ENST00000570989 WDR97A6NE52 1622 aa21.28■■□□□ 1
ITGA3-216ENST00000570989 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.27■□□□□ 0.99
ITGA3-216ENST00000570989 ARAP1Q96P48 1450 aa21.22■□□□□ 0.99
ITGA3-216ENST00000570989 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ITGA3-216ENST00000570989 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.21■□□□□ 0.99
ITGA3-216ENST00000570989 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.17■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 CUL7Q14999 1698 aa21.17■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 IFT140Q96RY7 1462 aa21.15■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.15■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 APLP2Q06481 763 aa21.14■□□□□ 0.98
ITGA3-216ENST00000570989 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ITGA3-216ENST00000570989 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.09■□□□□ 0.97
ITGA3-216ENST00000570989 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ITGA3-216ENST00000570989 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
ITGA3-216ENST00000570989 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.04■□□□□ 0.96
ITGA3-216ENST00000570989 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.02■□□□□ 0.96
ITGA3-216ENST00000570989 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ITGA3-216ENST00000570989 PBRM1Q86U86 1689 aa20.97■□□□□ 0.95
ITGA3-216ENST00000570989 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ITGA3-216ENST00000570989 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-216ENST00000570989 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-216ENST00000570989 BCL11AQ9H165 835 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-216ENST00000570989 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 KCNH8Q96L42 1107 aa20.87■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 ADAMTS12P58397 1594 aa20.87■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.87■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.86■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 CHD1O14646 1710 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 GRIN2BQ13224 1484 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 TIAM1Q13009 1591 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 MAP3K1Q13233 1512 aa20.83■□□□□ 0.93
ITGA3-216ENST00000570989 P3H3Q8IVL6 736 aa20.83■□□□□ 0.92
ITGA3-216ENST00000570989 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-216ENST00000570989 MAPKBP1O60336 1514 aa20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-216ENST00000570989 SAMD9Q5K651 1589 aa20.81■□□□□ 0.92
ITGA3-216ENST00000570989 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-216ENST00000570989 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.76■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 FMN1Q68DA7 1419 aa20.74■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.74■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.73■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.73■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.73■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 FBLN2P98095 1184 aa20.72■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 IQGAP2Q13576 1575 aa20.72■□□□□ 0.91
ITGA3-216ENST00000570989 BCANQ96GW7 911 aa20.7■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.67■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 SYNJ2O15056 1496 aa20.67■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 OSCARQ8IYS5 282 aa20.67■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 ITGAEP38570 1179 aa20.66■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 FKBP8Q14318 412 aa20.66■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ITGA3-216ENST00000570989 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 GRIN2AQ12879 1464 aa20.63■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.6■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.59■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.58■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.58■□□□□ 0.89
ITGA3-216ENST00000570989 CEP170Q5SW79 1584 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-216ENST00000570989 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-216ENST00000570989 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-216ENST00000570989 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-216ENST00000570989 KIAA0556O60303 1618 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 HECW1Q76N89 1606 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 DISP1Q96F81 1524 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 CCER2I3L3R5 266 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 NUP160Q12769 1436 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 NEFLP07196 543 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-216ENST00000570989 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 TRIM52Q96A61 297 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGEF11O15085 1522 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 NCOA2Q15596 1464 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.4■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ITGA3-216ENST00000570989 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 ANP32CO43423 234 aa20.38■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 MSH5O43196 834 aa20.37■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 SHROOM2Q13796 1616 aa20.36■□□□□ 0.85
ITGA3-216ENST00000570989 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms