RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.23■■■□□ 2.43
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ITGA3-216ENST00000570989 ABCC9O60706 1549 aa25.47■■□□□ 1.67
ITGA3-216ENST00000570989 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGA3-216ENST00000570989 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.95■■□□□ 1.58
ITGA3-216ENST00000570989 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.9■■□□□ 1.58
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ITGA3-216ENST00000570989 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.46■■□□□ 1.51
ITGA3-216ENST00000570989 NACADO15069 1562 aa24.45■■□□□ 1.5
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ITGA3-216ENST00000570989 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.15■■□□□ 1.46
ITGA3-216ENST00000570989 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.14■■□□□ 1.45
ITGA3-216ENST00000570989 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.95■■□□□ 1.42
ITGA3-216ENST00000570989 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.85■■□□□ 1.41
ITGA3-216ENST00000570989 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
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ITGA3-216ENST00000570989 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-216ENST00000570989 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-216ENST00000570989 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-216ENST00000570989 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.4■■□□□ 1.34
ITGA3-216ENST00000570989 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
ITGA3-216ENST00000570989 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-216ENST00000570989 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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ITGA3-216ENST00000570989 SMARCA4P51532 1647 aa23.18■■□□□ 1.3
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ITGA3-216ENST00000570989 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.05■■□□□ 1.28
ITGA3-216ENST00000570989 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ITGA3-216ENST00000570989 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-216ENST00000570989 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ITGA3-216ENST00000570989 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.85■■□□□ 1.25
ITGA3-216ENST00000570989 MYT1Q01538 1121 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGA3-216ENST00000570989 SMARCA2P51531 1590 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.75■■□□□ 1.23
ITGA3-216ENST00000570989 TRIM41Q8WV44 630 aa22.73■■□□□ 1.23
ITGA3-216ENST00000570989 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.7■■□□□ 1.22
ITGA3-216ENST00000570989 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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ITGA3-216ENST00000570989 NCAPD3P42695 1498 aa22.57■■□□□ 1.2
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ITGA3-216ENST00000570989 ABCC8Q09428 1581 aa22.45■■□□□ 1.18
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ITGA3-216ENST00000570989 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ITGA3-216ENST00000570989 NEUROD1Q13562 356 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-216ENST00000570989 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
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ITGA3-216ENST00000570989 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
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ITGA3-216ENST00000570989 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.15■■□□□ 1.14
ITGA3-216ENST00000570989 NESP48681 1621 aa22.14■■□□□ 1.14
ITGA3-216ENST00000570989 SYNJ1O43426 1573 aa22.14■■□□□ 1.13
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ITGA3-216ENST00000570989 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-216ENST00000570989 PRDM2Q13029 1718 aa21.95■■□□□ 1.11
ITGA3-216ENST00000570989 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-216ENST00000570989 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGA3-216ENST00000570989 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
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ITGA3-216ENST00000570989 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.89■■□□□ 1.1
ITGA3-216ENST00000570989 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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ITGA3-216ENST00000570989 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-216ENST00000570989 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.82■■□□□ 1.08
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ITGA3-216ENST00000570989 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.75■■□□□ 1.07
ITGA3-216ENST00000570989 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.74■■□□□ 1.07
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ITGA3-216ENST00000570989 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.56■■□□□ 1.04
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ITGA3-216ENST00000570989 CUX2O14529 1486 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-216ENST00000570989 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-216ENST00000570989 TOPBP1Q92547 1522 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-216ENST00000570989 CLIP1P30622 1438 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGA3-216ENST00000570989 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-216ENST00000570989 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGA3-216ENST00000570989 IGF1RP08069 1367 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGA3-216ENST00000570989 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.35■■□□□ 1.01
ITGA3-216ENST00000570989 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.35■■□□□ 1.01
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