RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 CLIP1P30622 1438 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 IGF1RP08069 1367 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-204ENST00000546621 WDR97A6NE52 1622 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-204ENST00000546621 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-204ENST00000546621 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-204ENST00000546621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 CUL7Q14999 1698 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 WDR62O43379 1518 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 ARAP1Q96P48 1450 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-204ENST00000546621 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 ERCC6Q03468 1493 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 IFT140Q96RY7 1462 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 PBRM1Q86U86 1689 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-204ENST00000546621 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 APLP2Q06481 763 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 27.7
CS-204ENST00000546621 KCNA4P22459 653 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 GRIN2BQ13224 1484 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 ADAMTS12P58397 1594 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-204ENST00000546621 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-204ENST00000546621 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-204ENST00000546621 MAP3K1Q13233 1512 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 SAMD9Q5K651 1589 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 P3H3Q8IVL6 736 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 TIAM1Q13009 1591 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 IQGAP2Q13576 1575 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 FMN1Q68DA7 1419 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-204ENST00000546621 GRIN2AQ12879 1464 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 BCL11AQ9H165 835 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 SYNJ2O15056 1496 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-204ENST00000546621 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CEP170Q5SW79 1584 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 KIAA0556O60303 1618 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 NUP160Q12769 1436 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 DISP1Q96F81 1524 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 HECW1Q76N89 1606 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 FBLN2P98095 1184 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.58□□□□□ -0.55
CS-204ENST00000546621 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 SLC4A2P04920 1241 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 CHD1O14646 1710 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-204ENST00000546621 JPH4Q96JJ6 628 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 NCOA2Q15596 1464 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 ARHGEF11O15085 1522 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 ITGAEP38570 1179 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 CAPN15O75808 1086 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-204ENST00000546621 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 SHROOM2Q13796 1616 aa11.44□□□□□ -0.58
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