RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 MAP3K1Q13233 1512 aa31■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.99■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 P3H3Q8IVL6 736 aa30.99■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.95■■■□□ 2.54
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
TMEM200B-202ENST00000521452 PRDM2Q13029 1718 aa30.94■■■□□ 2.54
TMEM200B-202ENST00000521452 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.87■■■□□ 2.53
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR97A6NE52 1622 aa30.83■■■□□ 2.53
TMEM200B-202ENST00000521452 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TMEM200B-202ENST00000521452 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.78■■■□□ 2.52
TMEM200B-202ENST00000521452 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.73■■■□□ 2.51
TMEM200B-202ENST00000521452 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
TMEM200B-202ENST00000521452 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.7■■■□□ 2.51
TMEM200B-202ENST00000521452 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.7■■■□□ 2.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
TMEM200B-202ENST00000521452 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.65■■■□□ 2.5
TMEM200B-202ENST00000521452 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.64■■■□□ 2.5
TMEM200B-202ENST00000521452 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
TMEM200B-202ENST00000521452 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.61■■■□□ 2.49
TMEM200B-202ENST00000521452 BCANQ96GW7 911 aa30.58■■■□□ 2.49
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.57■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.54■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.53■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.53■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 TOPBP1Q92547 1522 aa30.52■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 FKBP8Q14318 412 aa30.51■■■□□ 2.48
TMEM200B-202ENST00000521452 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.51■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 FMN1Q68DA7 1419 aa30.46■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 ANP32CO43423 234 aa30.46■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM52Q96A61 297 aa30.45■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.45■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 NESP48681 1621 aa30.45■■■□□ 2.47
TMEM200B-202ENST00000521452 TONSLQ96HA7 1378 aa30.45■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 PTPRKQ15262 1439 aa30.44■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.42■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.42■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 CCER2I3L3R5 266 aa30.42■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 CUL7Q14999 1698 aa30.4■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.39■■■□□ 2.46
TMEM200B-202ENST00000521452 HFM1A2PYH4 1435 aa30.37■■■□□ 2.45
TMEM200B-202ENST00000521452 UACAQ9BZF9 1416 aa30.35■■■□□ 2.45
TMEM200B-202ENST00000521452 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TMEM200B-202ENST00000521452 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.3■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NAIPQ13075 1403 aa30.29■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.29■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NCOA2Q15596 1464 aa30.29■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NEFLP07196 543 aa30.28■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.27■■■□□ 2.44
TMEM200B-202ENST00000521452 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TMEM200B-202ENST00000521452 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.23■■■□□ 2.43
TMEM200B-202ENST00000521452 GRIN2BQ13224 1484 aa30.21■■■□□ 2.43
TMEM200B-202ENST00000521452 SAMD9Q5K651 1589 aa30.21■■■□□ 2.43
TMEM200B-202ENST00000521452 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.19■■■□□ 2.42
TMEM200B-202ENST00000521452 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.17■■■□□ 2.42
TMEM200B-202ENST00000521452 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.17■■■□□ 2.42
TMEM200B-202ENST00000521452 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.15■■■□□ 2.42
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.13■■■□□ 2.41
TMEM200B-202ENST00000521452 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.12■■■□□ 2.41
TMEM200B-202ENST00000521452 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.1■■■□□ 2.41
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.08■■■□□ 2.41
TMEM200B-202ENST00000521452 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.07■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.05■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.03■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF11O15085 1522 aa30.02■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
TMEM200B-202ENST00000521452 ARID3CA6NKF2 412 aa29.98■■■□□ 2.39
TMEM200B-202ENST00000521452 FOXD1Q16676 465 aa29.95■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM6BO15054 1643 aa29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.92■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.91■■■□□ 2.38
TMEM200B-202ENST00000521452 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.87■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 HECW1Q76N89 1606 aa29.87■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC184Q52MB2 194 aa29.87■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 AKNAQ7Z591 1439 aa29.84■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.83■■■□□ 2.37
TMEM200B-202ENST00000521452 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
TMEM200B-202ENST00000521452 MIA2Q96PC5 1412 aa29.81■■■□□ 2.36
TMEM200B-202ENST00000521452 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.79■■■□□ 2.36
TMEM200B-202ENST00000521452 IQGAP2Q13576 1575 aa29.77■■■□□ 2.36
TMEM200B-202ENST00000521452 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.75■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC7Q96M83 1385 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.73■■■□□ 2.35
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