RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.12□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 ARID3CA6NKF2 412 aa8.11□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.11□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.11□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.1□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 PLCB2Q00722 1185 aa8.09□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 JPH4Q96JJ6 628 aa8.09□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 IGF1RP08069 1367 aa8.08□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 SYNJ2O15056 1496 aa8.08□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.07□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.06□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 CHD1O14646 1710 aa8.04□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 GRIN2AQ12879 1464 aa8.04□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.03□□□□□ -1.12
CLVS1-205ENST00000519846 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.02□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 PBRM1Q86U86 1689 aa8.01□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.01□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF11O15085 1522 aa8□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.99□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 FKBP8Q14318 412 aa7.99□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.99□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 ADAMTS12P58397 1594 aa7.99□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 WDR97A6NE52 1622 aa7.97□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 KCNH8Q96L42 1107 aa7.97□□□□□ -1.13
CLVS1-205ENST00000519846 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.96□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 PTPRGP23470 1445 aa7.96□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 BCANQ96GW7 911 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 CEP170Q5SW79 1584 aa7.95□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 ARAP1Q96P48 1450 aa7.94□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 NUP160Q12769 1436 aa7.94□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.93□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.93□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 EEA1Q15075 1411 aa7.92□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.92□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 SLC4A2P04920 1241 aa7.91□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 CUL7Q14999 1698 aa7.91□□□□□ -1.14
CLVS1-205ENST00000519846 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.89□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.89□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.89□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 PRXQ9BXM0 1461 aa7.88□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 IQGAP2Q13576 1575 aa7.88□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.87□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 GOLGA3Q08378 1498 aa7.87□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.87□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 APLP2Q06481 763 aa7.84□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 ARXQ96QS3 562 aa7.84□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CLVS1-205ENST00000519846 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.83□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.83□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.83□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 UACAQ9BZF9 1416 aa7.82□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 CLIP1P30622 1438 aa7.81□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.8□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 DISP1Q96F81 1524 aa7.8□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CLVS1-205ENST00000519846 PROM2Q8N271 834 aa7.77□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.77□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 ASXL2Q76L83 1435 aa7.77□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA0556O60303 1618 aa7.76□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 KIF21BO75037 1637 aa7.75□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 SHROOM2Q13796 1616 aa7.75□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.75□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 CEP162Q5TB80 1403 aa7.75□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC2Q92887 1545 aa7.74□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 FMN1Q68DA7 1419 aa7.73□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.73□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.72□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.72□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.72□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 TSPOAP1O95153 1857 aa7.71□□□□□ -1.17
CLVS1-205ENST00000519846 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 MLECQ14165 292 aa7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 ATP10BO94823 1461 aa7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 CD109Q6YHK3 1445 aa7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 RAPGEF3O95398 923 aa7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 ITGAEP38570 1179 aa7.69□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.68□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.68□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.68□□□□□ -1.18
CLVS1-205ENST00000519846 PKD2Q13563 968 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms