RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488175.5

GCOM1-210, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,601 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-210ENST00000488175 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.45■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.44■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.44■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 TIAM1Q13009 1591 aa23.43■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.4■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 BCANQ96GW7 911 aa23.39■■□□□ 1.34
GCOM1-210ENST00000488175 WDR97A6NE52 1622 aa23.36■■□□□ 1.33
GCOM1-210ENST00000488175 MAP3K1Q13233 1512 aa23.34■■□□□ 1.33
GCOM1-210ENST00000488175 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
GCOM1-210ENST00000488175 FKBP8Q14318 412 aa23.29■■□□□ 1.32
GCOM1-210ENST00000488175 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GCOM1-210ENST00000488175 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
GCOM1-210ENST00000488175 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.27■■□□□ 1.32
GCOM1-210ENST00000488175 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.23■■□□□ 1.31
GCOM1-210ENST00000488175 TRIM52Q96A61 297 aa23.22■■□□□ 1.31
GCOM1-210ENST00000488175 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GCOM1-210ENST00000488175 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.2■■□□□ 1.3
GCOM1-210ENST00000488175 ANP32CO43423 234 aa23.16■■□□□ 1.3
GCOM1-210ENST00000488175 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.12■■□□□ 1.29
GCOM1-210ENST00000488175 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.11■■□□□ 1.29
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GCOM1-210ENST00000488175 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.11■■□□□ 1.29
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GCOM1-210ENST00000488175 TONSLQ96HA7 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
GCOM1-210ENST00000488175 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.07■■□□□ 1.28
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GCOM1-210ENST00000488175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
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GCOM1-210ENST00000488175 MTUS2Q5JR59 1369 aa23■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.96■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.96■■□□□ 1.27
GCOM1-210ENST00000488175 FMN1Q68DA7 1419 aa22.95■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 UACAQ9BZF9 1416 aa22.94■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 HFM1A2PYH4 1435 aa22.93■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 TOPBP1Q92547 1522 aa22.92■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.9■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.89■■□□□ 1.26
GCOM1-210ENST00000488175 NAIPQ13075 1403 aa22.89■■□□□ 1.25
GCOM1-210ENST00000488175 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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GCOM1-210ENST00000488175 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.87■■□□□ 1.25
GCOM1-210ENST00000488175 NESP48681 1621 aa22.87■■□□□ 1.25
GCOM1-210ENST00000488175 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.86■■□□□ 1.25
GCOM1-210ENST00000488175 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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GCOM1-210ENST00000488175 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.84■■□□□ 1.25
GCOM1-210ENST00000488175 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.83■■□□□ 1.25
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GCOM1-210ENST00000488175 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.79■■□□□ 1.24
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GCOM1-210ENST00000488175 GRIN2BQ13224 1484 aa22.75■■□□□ 1.23
GCOM1-210ENST00000488175 CCDC184Q52MB2 194 aa22.73■■□□□ 1.23
GCOM1-210ENST00000488175 FOXD1Q16676 465 aa22.72■■□□□ 1.23
GCOM1-210ENST00000488175 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.71■■□□□ 1.23
GCOM1-210ENST00000488175 ARID3CA6NKF2 412 aa22.71■■□□□ 1.23
GCOM1-210ENST00000488175 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
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GCOM1-210ENST00000488175 MSH5O43196 834 aa22.69■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.67■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.67■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.67■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GCOM1-210ENST00000488175 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.67■■□□□ 1.22
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GCOM1-210ENST00000488175 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.66■■□□□ 1.22
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GCOM1-210ENST00000488175 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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GCOM1-210ENST00000488175 KDM6BO15054 1643 aa22.6■■□□□ 1.21
GCOM1-210ENST00000488175 ARHGEF11O15085 1522 aa22.59■■□□□ 1.21
GCOM1-210ENST00000488175 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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GCOM1-210ENST00000488175 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.58■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 MRS2Q9HD23 443 aa22.57■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.56■■□□□ 1.2
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GCOM1-210ENST00000488175 BCL11AQ9H165 835 aa22.54■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.52■■□□□ 1.2
GCOM1-210ENST00000488175 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.51■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.51■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 NCOA1Q15788 1441 aa22.5■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 HECW1Q76N89 1606 aa22.5■■□□□ 1.19
GCOM1-210ENST00000488175 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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