RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-204ENST00000483092 NESP48681 1621 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-204ENST00000483092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-204ENST00000483092 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-204ENST00000483092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-204ENST00000483092 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-204ENST00000483092 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM52Q96A61 297 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-204ENST00000483092 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-204ENST00000483092 ARID3CA6NKF2 412 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-204ENST00000483092 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-204ENST00000483092 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-204ENST00000483092 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-204ENST00000483092 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-204ENST00000483092 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-204ENST00000483092 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-204ENST00000483092 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-204ENST00000483092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-204ENST00000483092 TOPBP1Q92547 1522 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM2Q13029 1718 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.78■■□□□ 1.24
CCSAP-204ENST00000483092 TIAM1Q13009 1591 aa22.77■■□□□ 1.24
CCSAP-204ENST00000483092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 MSH5O43196 834 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 NBR1Q14596 966 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-204ENST00000483092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-204ENST00000483092 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.69■■□□□ 1.22
CCSAP-204ENST00000483092 ANP32CO43423 234 aa22.65■■□□□ 1.22
CCSAP-204ENST00000483092 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CCSAP-204ENST00000483092 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-204ENST00000483092 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-204ENST00000483092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-204ENST00000483092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.21e-7■■■■□ 24.2
CCSAP-204ENST00000483092 MAPKBP1O60336 1514 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-204ENST00000483092 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-204ENST00000483092 FMN1Q68DA7 1419 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-204ENST00000483092 FBLN2P98095 1184 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-204ENST00000483092 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K1Q13233 1512 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 WDR97A6NE52 1622 aa22.45■■□□□ 1.19
CCSAP-204ENST00000483092 TONSLQ96HA7 1378 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 CUL7Q14999 1698 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRKQ15262 1439 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD1Q16676 465 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.41■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.4■■□□□ 1.18
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA2Q15596 1464 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.39■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.38■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.36■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.35■■□□□ 1.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 GRIN2BQ13224 1484 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 NAIPQ13075 1403 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 CCER2I3L3R5 266 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 HFM1A2PYH4 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD9Q5K651 1589 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 UACAQ9BZF9 1416 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC6Q03468 1493 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms