RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476615.1

TTL-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-203ENST00000476615 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTL-203ENST00000476615 OSCARQ8IYS5 282 aa16.28■□□□□ 0.2
TTL-203ENST00000476615 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 29
TTL-203ENST00000476615 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.28■□□□□ 0.2
TTL-203ENST00000476615 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.24■□□□□ 0.19
TTL-203ENST00000476615 TOP2BQ02880 1626 aa16.23■□□□□ 0.19
TTL-203ENST00000476615 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.23■□□□□ 0.19
TTL-203ENST00000476615 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 APLP2Q06481 763 aa16.19■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 SYNJ1O43426 1573 aa16.17■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 GRIN2BQ13224 1484 aa16.16■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.16■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 CHD1O14646 1710 aa16.15■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 FBXO3Q9UK99 471 aa16.15■□□□□ 0.18
TTL-203ENST00000476615 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.13■□□□□ 0.17
TTL-203ENST00000476615 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.1■□□□□ 0.17
TTL-203ENST00000476615 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.1■□□□□ 0.17
TTL-203ENST00000476615 PBRM1Q86U86 1689 aa16.09■□□□□ 0.17
TTL-203ENST00000476615 SYNJ2O15056 1496 aa16.09■□□□□ 0.17
TTL-203ENST00000476615 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.05■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.05■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.05■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.05■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 ARHGEF11O15085 1522 aa16.03■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.03■□□□□ 0.16
TTL-203ENST00000476615 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 ADAMTS12P58397 1594 aa15.98■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 PROM2Q8N271 834 aa15.98■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 TRIM41Q8WV44 630 aa15.97■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.96■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 FBLN2P98095 1184 aa15.96■□□□□ 0.15
TTL-203ENST00000476615 GRIN2AQ12879 1464 aa15.95■□□□□ 0.14
TTL-203ENST00000476615 NUP160Q12769 1436 aa15.94■□□□□ 0.14
TTL-203ENST00000476615 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTL-203ENST00000476615 ARAP1Q96P48 1450 aa15.9■□□□□ 0.14
TTL-203ENST00000476615 IGF1RP08069 1367 aa15.88■□□□□ 0.13
TTL-203ENST00000476615 CEP170Q5SW79 1584 aa15.87■□□□□ 0.13
TTL-203ENST00000476615 SHROOM2Q13796 1616 aa15.86■□□□□ 0.13
TTL-203ENST00000476615 KIF27Q86VH2 1401 aa15.86■□□□□ 0.13
TTL-203ENST00000476615 PLCB2Q00722 1185 aa15.83■□□□□ 0.12
TTL-203ENST00000476615 CUL7Q14999 1698 aa15.82■□□□□ 0.12
TTL-203ENST00000476615 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.8■□□□□ 0.12
TTL-203ENST00000476615 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TTL-203ENST00000476615 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TTL-203ENST00000476615 POLA2Q14181 598 aa15.76■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.76■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.75■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.73■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.72■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 JPH4Q96JJ6 628 aa15.71■□□□□ 0.11
TTL-203ENST00000476615 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TTL-203ENST00000476615 CAPN15O75808 1086 aa15.63■□□□□ 0.09
TTL-203ENST00000476615 PKD2Q13563 968 aa15.62■□□□□ 0.09
TTL-203ENST00000476615 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.61■□□□□ 0.09
TTL-203ENST00000476615 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTL-203ENST00000476615 PRXQ9BXM0 1461 aa15.6■□□□□ 0.09
TTL-203ENST00000476615 RNF39Q9H2S5 420 aa15.58■□□□□ 0.08
TTL-203ENST00000476615 IQGAP2Q13576 1575 aa15.57■□□□□ 0.08
TTL-203ENST00000476615 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.55■□□□□ 0.08
TTL-203ENST00000476615 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TTL-203ENST00000476615 DISP1Q96F81 1524 aa15.53■□□□□ 0.08
TTL-203ENST00000476615 EEA1Q15075 1411 aa15.51■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.5■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.5■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.49■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 MAPKBP1O60336 1514 aa15.48■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.48■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 PTPRGP23470 1445 aa15.46■□□□□ 0.07
TTL-203ENST00000476615 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.46■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.43■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 KIAA0556O60303 1618 aa15.43■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 ABCB7O75027 752 aa15.42■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.42■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 KLHL34Q8N239 644 aa15.42■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 SPOCK2Q92563 424 aa15.42■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 ABCC2Q92887 1545 aa15.4■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.4■□□□□ 0.06
TTL-203ENST00000476615 BCANQ96GW7 911 aa15.39■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 GOLGA3Q08378 1498 aa15.39■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 UACAQ9BZF9 1416 aa15.38■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.37■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 DIP2BQ9P265 1576 aa15.35■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 KIF21BO75037 1637 aa15.35■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.34■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 SAMD9Q5K651 1589 aa15.33■□□□□ 0.05
TTL-203ENST00000476615 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 ABCA8O94911 1581 aa15.32■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 GLI2P10070 1586 aa15.3■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.3■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 ASXL2Q76L83 1435 aa15.27■□□□□ 0.04
TTL-203ENST00000476615 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms