RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.71■□□□□ 0.58
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PTPRN-202ENST00000409251 KIF21BO75037 1637 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 TOPBP1Q92547 1522 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 ARAP1Q96P48 1450 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 KCNH8Q96L42 1107 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRN-202ENST00000409251 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
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PTPRN-202ENST00000409251 ERCC6Q03468 1493 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRN-202ENST00000409251 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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PTPRN-202ENST00000409251 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTPRN-202ENST00000409251 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.21■□□□□ 0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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PTPRN-202ENST00000409251 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRN-202ENST00000409251 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRN-202ENST00000409251 GRIN2BQ13224 1484 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRN-202ENST00000409251 CUL7Q14999 1698 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRN-202ENST00000409251 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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PTPRN-202ENST00000409251 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.03■□□□□ 0.48
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PTPRN-202ENST00000409251 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN-202ENST00000409251 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRN-202ENST00000409251 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRN-202ENST00000409251 NCOA2Q15596 1464 aa17.98■□□□□ 0.47
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PTPRN-202ENST00000409251 GRIN2AQ12879 1464 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRN-202ENST00000409251 WDR62O43379 1518 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRN-202ENST00000409251 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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PTPRN-202ENST00000409251 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
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PTPRN-202ENST00000409251 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.89■□□□□ 0.46
PTPRN-202ENST00000409251 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN-202ENST00000409251 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN-202ENST00000409251 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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