RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 CLIP1P30622 1438 aa17.46■□□□□ 0.39
CTXN3-202ENST00000395322 CUL7Q14999 1698 aa17.42■□□□□ 0.38
CTXN3-202ENST00000395322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.39■□□□□ 0.38
CTXN3-202ENST00000395322 IGF1RP08069 1367 aa17.39■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.39■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 SLC4A2P04920 1241 aa17.37■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.36■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.36■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.35■□□□□ 0.37
CTXN3-202ENST00000395322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTXN3-202ENST00000395322 WDR62O43379 1518 aa17.3■□□□□ 0.36
CTXN3-202ENST00000395322 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.28■□□□□ 0.36
CTXN3-202ENST00000395322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.27■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 PBRM1Q86U86 1689 aa17.25■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 ERCC6Q03468 1493 aa17.24■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 ARAP1Q96P48 1450 aa17.24■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 IFT140Q96RY7 1462 aa17.22■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 HRCP23327 699 aa17.21■□□□□ 0.35
CTXN3-202ENST00000395322 APLP2Q06481 763 aa17.2■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.2■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.17■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CTXN3-202ENST00000395322 CAPN15O75808 1086 aa17.12■□□□□ 0.33
CTXN3-202ENST00000395322 ADAMTS12P58397 1594 aa17.12■□□□□ 0.33
CTXN3-202ENST00000395322 GRIN2BQ13224 1484 aa17.12■□□□□ 0.33
CTXN3-202ENST00000395322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.1■□□□□ 0.33
CTXN3-202ENST00000395322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MAP3K1Q13233 1512 aa17.06■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 SAMD9Q5K651 1589 aa17.04■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.01■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 DSG3P32926 999 aa17■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TIAM1Q13009 1591 aa17■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.99■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FMN1Q68DA7 1419 aa16.98■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 IQGAP2Q13576 1575 aa16.98■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.96■□□□□ 0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.95■□□□□ 0.3
CTXN3-202ENST00000395322 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTXN3-202ENST00000395322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.94■□□□□ 0.3
CTXN3-202ENST00000395322 GRIN2AQ12879 1464 aa16.92■□□□□ 0.3
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CTXN3-202ENST00000395322 SYNJ2O15056 1496 aa16.89■□□□□ 0.3
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CTXN3-202ENST00000395322 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.88■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.88■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.88■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 P3H3Q8IVL6 736 aa16.86■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTXN3-202ENST00000395322 HECW1Q76N89 1606 aa16.83■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA0556O60303 1618 aa16.81■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.8■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.79■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 CEP170Q5SW79 1584 aa16.79■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.78■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.78■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CTXN3-202ENST00000395322 NUP160Q12769 1436 aa16.77■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.75■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 DISP1Q96F81 1524 aa16.73■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 ABCB7O75027 752 aa16.72■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.71■□□□□ 0.27
CTXN3-202ENST00000395322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.69■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 CHD1O14646 1710 aa16.68■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.68■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.68■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 FBLN2P98095 1184 aa16.67■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
CTXN3-202ENST00000395322 NCOA2Q15596 1464 aa16.63■□□□□ 0.25
CTXN3-202ENST00000395322 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.61■□□□□ 0.25
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGEF11O15085 1522 aa16.6■□□□□ 0.25
CTXN3-202ENST00000395322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.6■□□□□ 0.25
CTXN3-202ENST00000395322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CTXN3-202ENST00000395322 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 JPH4Q96JJ6 628 aa16.58■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.58■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.57■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 SHROOM2Q13796 1616 aa16.56■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 ZBTB22O15209 634 aa16.54■□□□□ 0.24
CTXN3-202ENST00000395322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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