RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369214.2

PRDM13-201, Transcript of PR/SET domain 13, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM13, Length 3,232 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13-201ENST00000369214 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.77■■□□□ 1.88
PRDM13-201ENST00000369214 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.74■■□□□ 1.87
PRDM13-201ENST00000369214 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.74■■□□□ 1.87
PRDM13-201ENST00000369214 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.74■■□□□ 1.87
PRDM13-201ENST00000369214 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PRDM13-201ENST00000369214 WDR97A6NE52 1622 aa26.64■■□□□ 1.86
PRDM13-201ENST00000369214 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PRDM13-201ENST00000369214 KCNH8Q96L42 1107 aa26.59■■□□□ 1.85
PRDM13-201ENST00000369214 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.59■■□□□ 1.85
PRDM13-201ENST00000369214 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.58■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 P3H3Q8IVL6 736 aa26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.54■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM13-201ENST00000369214 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.51■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.49■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.47■■□□□ 1.83
PRDM13-201ENST00000369214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.45■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 CUL7Q14999 1698 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 TOPBP1Q92547 1522 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM13-201ENST00000369214 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM13-201ENST00000369214 FMN1Q68DA7 1419 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM13-201ENST00000369214 CCER2I3L3R5 266 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM13-201ENST00000369214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.33■■□□□ 1.81
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 ANP32CO43423 234 aa26.28■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 TONSLQ96HA7 1378 aa26.28■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 HFM1A2PYH4 1435 aa26.28■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 FKBP8Q14318 412 aa26.27■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 UACAQ9BZF9 1416 aa26.27■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.27■■□□□ 1.8
PRDM13-201ENST00000369214 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.26■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 PTPRKQ15262 1439 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 BCANQ96GW7 911 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 SAMD9Q5K651 1589 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 NESP48681 1621 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM13-201ENST00000369214 NCOA2Q15596 1464 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 NAIPQ13075 1403 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 GRIN2BQ13224 1484 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 NEFLP07196 543 aa26.16■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 TRIM52Q96A61 297 aa26.15■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.14■■□□□ 1.78
PRDM13-201ENST00000369214 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PRDM13-201ENST00000369214 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.12■■□□□ 1.77
PRDM13-201ENST00000369214 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
PRDM13-201ENST00000369214 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.07■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.07■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.07■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.06■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.06■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 ARHGEF11O15085 1522 aa26.05■■□□□ 1.76
PRDM13-201ENST00000369214 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26■■□□□ 1.75
PRDM13-201ENST00000369214 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM13-201ENST00000369214 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PRDM13-201ENST00000369214 HECW1Q76N89 1606 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM13-201ENST00000369214 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 AKNAQ7Z591 1439 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.74
PRDM13-201ENST00000369214 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 KDM6BO15054 1643 aa25.86■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 MIA2Q96PC5 1412 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
PRDM13-201ENST00000369214 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.8■■□□□ 1.72
PRDM13-201ENST00000369214 IQGAP2Q13576 1575 aa25.8■■□□□ 1.72
PRDM13-201ENST00000369214 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.79■■□□□ 1.72
PRDM13-201ENST00000369214 PBRM1Q86U86 1689 aa25.78■■□□□ 1.72
PRDM13-201ENST00000369214 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRDM13-201ENST00000369214 WDR62O43379 1518 aa25.75■■□□□ 1.71
PRDM13-201ENST00000369214 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.75■■□□□ 1.71
PRDM13-201ENST00000369214 NCOA1Q15788 1441 aa25.72■■□□□ 1.71
PRDM13-201ENST00000369214 ADAMTS12P58397 1594 aa25.7■■□□□ 1.71
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC7Q96M83 1385 aa25.69■■□□□ 1.7
PRDM13-201ENST00000369214 ROCK1Q13464 1354 aa25.67■■□□□ 1.7
PRDM13-201ENST00000369214 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PRDM13-201ENST00000369214 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PRDM13-201ENST00000369214 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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