RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356487.9

GPI-201, Transcript of glucose-6-phosphate isomerase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPI, Length 2,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPI-201ENST00000356487 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.36■■■■■ 4.21
GPI-201ENST00000356487 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.33■■■■■ 4.21
GPI-201ENST00000356487 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.3■■■■■ 4.2
GPI-201ENST00000356487 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.28■■■■■ 4.2
GPI-201ENST00000356487 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.25■■■■■ 4.19
GPI-201ENST00000356487 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.21■■■■■ 4.19
GPI-201ENST00000356487 WDR97A6NE52 1622 aa41.2■■■■■ 4.19
GPI-201ENST00000356487 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.18■■■■■ 4.18
GPI-201ENST00000356487 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
GPI-201ENST00000356487 KCNH8Q96L42 1107 aa41.1■■■■■ 4.17
GPI-201ENST00000356487 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa41.07■■■■■ 4.17
GPI-201ENST00000356487 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.161e-9■■■■□ 19.5
GPI-201ENST00000356487 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
GPI-201ENST00000356487 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.03■■■■■ 4.16
GPI-201ENST00000356487 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.02■■■■■ 4.16
GPI-201ENST00000356487 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.01■■■■■ 4.15
GPI-201ENST00000356487 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.154e-9■■■■■ 28.4
GPI-201ENST00000356487 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
GPI-201ENST00000356487 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
GPI-201ENST00000356487 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.94■■■■■ 4.14
GPI-201ENST00000356487 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.88■■■■■ 4.13
GPI-201ENST00000356487 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.85■■■■■ 4.13
GPI-201ENST00000356487 CCER2I3L3R5 266 aa40.83■■■■■ 4.13
GPI-201ENST00000356487 P3H3Q8IVL6 736 aa40.82■■■■■ 4.12
GPI-201ENST00000356487 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.81■■■■■ 4.12
GPI-201ENST00000356487 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.81■■■■■ 4.12
GPI-201ENST00000356487 CUL7Q14999 1698 aa40.81■■■■■ 4.12
GPI-201ENST00000356487 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.79■■■■■ 4.12
GPI-201ENST00000356487 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.75■■■■■ 4.11
GPI-201ENST00000356487 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
GPI-201ENST00000356487 FMN1Q68DA7 1419 aa40.7■■■■■ 4.11
GPI-201ENST00000356487 FKBP8Q14318 412 aa40.7■■■■■ 4.11
GPI-201ENST00000356487 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.68■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 ANP32CO43423 234 aa40.67■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.66■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.65■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 TOPBP1Q92547 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 HFM1A2PYH4 1435 aa40.64■■■■■ 4.1
GPI-201ENST00000356487 UACAQ9BZF9 1416 aa40.62■■■■■ 4.09
GPI-201ENST00000356487 TONSLQ96HA7 1378 aa40.61■■■■■ 4.09
GPI-201ENST00000356487 BCANQ96GW7 911 aa40.59■■■■■ 4.09
GPI-201ENST00000356487 ANP32EQ9BTT0 268 aa40.59■■■■■ 4.09
GPI-201ENST00000356487 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.59■■■■■ 4.09
GPI-201ENST00000356487 NEFLP07196 543 aa40.56■■■■■ 4.08
GPI-201ENST00000356487 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
GPI-201ENST00000356487 NESP48681 1621 aa40.52■■■■■ 4.08
GPI-201ENST00000356487 PTPRKQ15262 1439 aa40.51■■■■■ 4.08
GPI-201ENST00000356487 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.51■■■■■ 4.07
GPI-201ENST00000356487 SAMD9Q5K651 1589 aa40.5■■■■■ 4.07
GPI-201ENST00000356487 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
GPI-201ENST00000356487 NAIPQ13075 1403 aa40.44■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.44■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.43■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 TRIM52Q96A61 297 aa40.43■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 NCOA2Q15596 1464 aa40.4■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.39■■■■■ 4.06
GPI-201ENST00000356487 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
GPI-201ENST00000356487 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.35■■■■■ 4.05
GPI-201ENST00000356487 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.32■■■■■ 4.05
GPI-201ENST00000356487 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.3■■■■■ 4.04
GPI-201ENST00000356487 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.26■■■■■ 4.04
GPI-201ENST00000356487 ARHGEF11O15085 1522 aa40.26■■■■■ 4.04
GPI-201ENST00000356487 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.26■■■■■ 4.04
GPI-201ENST00000356487 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
GPI-201ENST00000356487 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
GPI-201ENST00000356487 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.19■■■■■ 4.03
GPI-201ENST00000356487 HECW1Q76N89 1606 aa40.18■■■■■ 4.02
GPI-201ENST00000356487 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
GPI-201ENST00000356487 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.14■■■■■ 4.02
GPI-201ENST00000356487 AKNAQ7Z591 1439 aa40.14■■■■■ 4.02
GPI-201ENST00000356487 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.09■■■■■ 4.01
GPI-201ENST00000356487 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.08■■■■■ 4.01
GPI-201ENST00000356487 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
GPI-201ENST00000356487 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
GPI-201ENST00000356487 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.03■■■■■ 4
GPI-201ENST00000356487 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 41e-8■■■□□ 15.8
GPI-201ENST00000356487 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
GPI-201ENST00000356487 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.95■■■■□ 3.99
GPI-201ENST00000356487 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.93■■■■□ 3.98
GPI-201ENST00000356487 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.92■■■■□ 3.98
GPI-201ENST00000356487 MIA2Q96PC5 1412 aa39.92■■■■□ 3.98
GPI-201ENST00000356487 KDM6BO15054 1643 aa39.91■■■■□ 3.98
GPI-201ENST00000356487 ERICH6BQ5W0A0 696 aa39.89■■■■□ 3.98
GPI-201ENST00000356487 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
GPI-201ENST00000356487 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.84■■■■□ 3.97
GPI-201ENST00000356487 NCOA1Q15788 1441 aa39.82■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.81■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 ERCC6Q03468 1493 aa39.78■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 IQGAP2Q13576 1575 aa39.76■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 FANCIQ9NVI1 1328 aa39.76■■■■□ 3.96
GPI-201ENST00000356487 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 CCDC7Q96M83 1385 aa39.75■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.74■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 WDR62O43379 1518 aa39.73■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 ROCK1Q13464 1354 aa39.7■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 PBRM1Q86U86 1689 aa39.7■■■■□ 3.95
GPI-201ENST00000356487 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms