RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 KCNH8Q96L42 1107 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB4-201ENST00000332503 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 38.3
HOXB4-201ENST00000332503 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB4-201ENST00000332503 KIF27Q86VH2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.083e-8■■■■□ 19.6
HOXB4-201ENST00000332503 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB4-201ENST00000332503 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGEF11O15085 1522 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 SAMD9Q5K651 1589 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 IGF1RP08069 1367 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB4-201ENST00000332503 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 HECW1Q76N89 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 NCOA2Q15596 1464 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CCER2I3L3R5 266 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 CUL7Q14999 1698 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXB4-201ENST00000332503 MSH5O43196 834 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 BCL11AQ9H165 835 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 PTPRKQ15262 1439 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXB4-201ENST00000332503 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXB4-201ENST00000332503 HFM1A2PYH4 1435 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB4-201ENST00000332503 APLP2Q06481 763 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 KDM6BO15054 1643 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 UACAQ9BZF9 1416 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 GRIN2BQ13224 1484 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB4-201ENST00000332503 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 NAIPQ13075 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 AKNAQ7Z591 1439 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB4-201ENST00000332503 FKBP8Q14318 412 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB4-201ENST00000332503 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXB4-201ENST00000332503 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.32■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.31■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 E9PCH4 1651 aa21.29■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.27■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 NCOA1Q15788 1441 aa21.27■■□□□ 1
HOXB4-201ENST00000332503 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.27■■□□□ 1
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HOXB4-201ENST00000332503 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 MBD5Q9P267 1494 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 TOPBP1Q92547 1522 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXB4-201ENST00000332503 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 FMN1Q68DA7 1419 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 BCANQ96GW7 911 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXB4-201ENST00000332503 PBRM1Q86U86 1689 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 KDM5CP41229 1560 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 NESP48681 1621 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM52Q96A61 297 aa21.1■□□□□ 0.97
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HOXB4-201ENST00000332503 KIF14Q15058 1648 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 ITGAEP38570 1179 aa21.07■□□□□ 0.96
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HOXB4-201ENST00000332503 CCDC184Q52MB2 194 aa21.05■□□□□ 0.96
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HOXB4-201ENST00000332503 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
HOXB4-201ENST00000332503 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 MIA2Q96PC5 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC7Q96M83 1385 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 TONSLQ96HA7 1378 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB4-201ENST00000332503 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.97■□□□□ 0.95
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