RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.62■■□□□ 1.53
SEPHS1-201ENST00000327347 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.62■■□□□ 1.53
SEPHS1-201ENST00000327347 HMGXB3Q12766 1538 aa24.61■■□□□ 1.53
SEPHS1-201ENST00000327347 FKBP8Q14318 412 aa24.59■■□□□ 1.53
SEPHS1-201ENST00000327347 MAPKBP1O60336 1514 aa24.59■■□□□ 1.53
SEPHS1-201ENST00000327347 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.57■■□□□ 1.52
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM52Q96A61 297 aa24.56■■□□□ 1.52
SEPHS1-201ENST00000327347 TIAM1Q13009 1591 aa24.53■■□□□ 1.52
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR97A6NE52 1622 aa24.51■■□□□ 1.51
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
SEPHS1-201ENST00000327347 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
SEPHS1-201ENST00000327347 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.47■■□□□ 1.51
SEPHS1-201ENST00000327347 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.43■■□□□ 1.5
SEPHS1-201ENST00000327347 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SEPHS1-201ENST00000327347 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.39■■□□□ 1.49
SEPHS1-201ENST00000327347 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SEPHS1-201ENST00000327347 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.37■■□□□ 1.49
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SEPHS1-201ENST00000327347 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.36■■□□□ 1.49
SEPHS1-201ENST00000327347 ANP32CO43423 234 aa24.32■■□□□ 1.48
SEPHS1-201ENST00000327347 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SEPHS1-201ENST00000327347 MAP3K1Q13233 1512 aa24.28■■□□□ 1.48
SEPHS1-201ENST00000327347 TONSLQ96HA7 1378 aa24.27■■□□□ 1.48
SEPHS1-201ENST00000327347 NEFLP07196 543 aa24.26■■□□□ 1.47
SEPHS1-201ENST00000327347 BCL11AQ9H165 835 aa24.26■■□□□ 1.47
SEPHS1-201ENST00000327347 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.24■■□□□ 1.47
SEPHS1-201ENST00000327347 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.21■■□□□ 1.47
SEPHS1-201ENST00000327347 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.2■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 ARID3CA6NKF2 412 aa24.18■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.18■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.17■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 PRDM2Q13029 1718 aa24.17■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 NESP48681 1621 aa24.17■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.16■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPRKQ15262 1439 aa24.15■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.15■■□□□ 1.46
SEPHS1-201ENST00000327347 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.14■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.14■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.13■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.13■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 CCER2I3L3R5 266 aa24.1■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SEPHS1-201ENST00000327347 TOPBP1Q92547 1522 aa24.06■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.06■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 FMN1Q68DA7 1419 aa24.03■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.03■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXD1Q16676 465 aa24.02■■□□□ 1.44
SEPHS1-201ENST00000327347 UACAQ9BZF9 1416 aa24■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 EFCAB5A4FU69 1503 aa24■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 NCOA2Q15596 1464 aa23.98■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 HFM1A2PYH4 1435 aa23.98■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 NAIPQ13075 1403 aa23.98■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.97■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 MSH5O43196 834 aa23.96■■□□□ 1.43
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.95■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.93■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.93■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC184Q52MB2 194 aa23.92■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.91■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.9■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.9■■□□□ 1.42
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.87■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 CUL7Q14999 1698 aa23.86■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.84■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.83■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.83■■□□□ 1.41
SEPHS1-201ENST00000327347 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.81■■□□□ 1.4
SEPHS1-201ENST00000327347 GRIN2BQ13224 1484 aa23.81■■□□□ 1.4
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.8■■□□□ 1.4
SEPHS1-201ENST00000327347 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.79■■□□□ 1.4
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.79■■□□□ 1.4
SEPHS1-201ENST00000327347 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.76■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM6BO15054 1643 aa23.75■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 MRS2Q9HD23 443 aa23.75■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 NBR1Q14596 966 aa23.73■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 SAMD9Q5K651 1589 aa23.73■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.72■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.71■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SEPHS1-201ENST00000327347 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.7■■□□□ 1.38
SEPHS1-201ENST00000327347 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.65■■□□□ 1.38
SEPHS1-201ENST00000327347 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.64■■□□□ 1.37
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC7Q96M83 1385 aa23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms