RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317683.3

FBXO46-201, Transcript of F-box protein 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene FBXO46, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO46-201ENST00000317683 TOPBP1Q92547 1522 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXO46-201ENST00000317683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.2■■□□□ 1.14
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FBXO46-201ENST00000317683 PRDM2Q13029 1718 aa22.19■■□□□ 1.14
FBXO46-201ENST00000317683 IL27Q8NEV9 243 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXO46-201ENST00000317683 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO46-201ENST00000317683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FBXO46-201ENST00000317683 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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FBXO46-201ENST00000317683 CEP162Q5TB80 1403 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO46-201ENST00000317683 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.12■■□□□ 1.13
FBXO46-201ENST00000317683 EEA1Q15075 1411 aa22.1■■□□□ 1.13
FBXO46-201ENST00000317683 BCANQ96GW7 911 aa22.1■■□□□ 1.13
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FBXO46-201ENST00000317683 IGF1RP08069 1367 aa22.08■■□□□ 1.12
FBXO46-201ENST00000317683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.07■■□□□ 1.12
FBXO46-201ENST00000317683 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.04■■□□□ 1.12
FBXO46-201ENST00000317683 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FBXO46-201ENST00000317683 P3H3Q8IVL6 736 aa22.03■■□□□ 1.12
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FBXO46-201ENST00000317683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
FBXO46-201ENST00000317683 CLIP1P30622 1438 aa21.91■■□□□ 1.1
FBXO46-201ENST00000317683 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.91■■□□□ 1.1
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FBXO46-201ENST00000317683 ZMYND15Q9H091 742 aa21.9■■□□□ 1.1
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FBXO46-201ENST00000317683 PDE4CQ08493 712 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXO46-201ENST00000317683 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.83■■□□□ 1.08
FBXO46-201ENST00000317683 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
FBXO46-201ENST00000317683 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.8■■□□□ 1.08
FBXO46-201ENST00000317683 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.79■■□□□ 1.08
FBXO46-201ENST00000317683 NBR1Q14596 966 aa21.79■■□□□ 1.08
FBXO46-201ENST00000317683 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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FBXO46-201ENST00000317683 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.75■■□□□ 1.07
FBXO46-201ENST00000317683 ITGAEP38570 1179 aa21.74■■□□□ 1.07
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FBXO46-201ENST00000317683 ARAP1Q96P48 1450 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO46-201ENST00000317683 FKBP8Q14318 412 aa21.71■■□□□ 1.07
FBXO46-201ENST00000317683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.7■■□□□ 1.06
FBXO46-201ENST00000317683 ARID3CA6NKF2 412 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO46-201ENST00000317683 KLHL34Q8N239 644 aa21.69■■□□□ 1.06
FBXO46-201ENST00000317683 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
FBXO46-201ENST00000317683 WDR62O43379 1518 aa21.69■■□□□ 1.06
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FBXO46-201ENST00000317683 WDR97A6NE52 1622 aa21.67■■□□□ 1.06
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FBXO46-201ENST00000317683 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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FBXO46-201ENST00000317683 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.59■■□□□ 1.05
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FBXO46-201ENST00000317683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.57■■□□□ 1.04
FBXO46-201ENST00000317683 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.57■■□□□ 1.04
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FBXO46-201ENST00000317683 GRIN2BQ13224 1484 aa21.53■■□□□ 1.04
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FBXO46-201ENST00000317683 PBRM1Q86U86 1689 aa21.51■■□□□ 1.03
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FBXO46-201ENST00000317683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.47■■□□□ 1.03
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FBXO46-201ENST00000317683 CEP170Q5SW79 1584 aa21.24■□□□□ 0.99
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FBXO46-201ENST00000317683 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.12■□□□□ 0.97
FBXO46-201ENST00000317683 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FBXO46-201ENST00000317683 TIAM1Q13009 1591 aa21.11■□□□□ 0.97
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FBXO46-201ENST00000317683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.11■□□□□ 0.97
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