RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.64■■□□□ 1.7
TRAF4-201ENST00000262395 IGF1RP08069 1367 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 WDR97A6NE52 1622 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 NCAPD3P42695 1498 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 CFTRP13569 1480 aa25.59■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 TIAM1Q13009 1591 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 TRIM52Q96A61 297 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAF4-201ENST00000262395 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAF4-201ENST00000262395 HMGXB3Q12766 1538 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAF4-201ENST00000262395 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAF4-201ENST00000262395 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAF4-201ENST00000262395 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAF4-201ENST00000262395 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-201ENST00000262395 ANP32CO43423 234 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-201ENST00000262395 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAF4-201ENST00000262395 NEFLP07196 543 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-201ENST00000262395 BCL11AQ9H165 835 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAF4-201ENST00000262395 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRAF4-201ENST00000262395 MAP3K1Q13233 1512 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAF4-201ENST00000262395 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAF4-201ENST00000262395 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAF4-201ENST00000262395 TONSLQ96HA7 1378 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAF4-201ENST00000262395 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAF4-201ENST00000262395 CCER2I3L3R5 266 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-201ENST00000262395 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAF4-201ENST00000262395 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAF4-201ENST00000262395 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-201ENST00000262395 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAF4-201ENST00000262395 PRDM2Q13029 1718 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 PTPRKQ15262 1439 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAF4-201ENST00000262395 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAF4-201ENST00000262395 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAF4-201ENST00000262395 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAF4-201ENST00000262395 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAF4-201ENST00000262395 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAF4-201ENST00000262395 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 48.2
TRAF4-201ENST00000262395 UACAQ9BZF9 1416 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAF4-201ENST00000262395 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.61e-7■■□□□ 12.7
TRAF4-201ENST00000262395 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAF4-201ENST00000262395 HFM1A2PYH4 1435 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAF4-201ENST00000262395 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAF4-201ENST00000262395 MSH5O43196 834 aa25■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 NAIPQ13075 1403 aa25■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 FMN1Q68DA7 1419 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC184Q52MB2 194 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 ARID3CA6NKF2 412 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 NESP48681 1621 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 FOXD1Q16676 465 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 NCOA2Q15596 1464 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAF4-201ENST00000262395 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 TOPBP1Q92547 1522 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAF4-201ENST00000262395 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAF4-201ENST00000262395 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAF4-201ENST00000262395 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
TRAF4-201ENST00000262395 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAF4-201ENST00000262395 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAF4-201ENST00000262395 CUL7Q14999 1698 aa24.83■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 GRIN2BQ13224 1484 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 MRS2Q9HD23 443 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 KDM6BO15054 1643 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-201ENST00000262395 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 SAMD9Q5K651 1589 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAF4-201ENST00000262395 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAF4-201ENST00000262395 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAF4-201ENST00000262395 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAF4-201ENST00000262395 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC7Q96M83 1385 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAF4-201ENST00000262395 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRAF4-201ENST00000262395 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TRAF4-201ENST00000262395 NCOA1Q15788 1441 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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