RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216271.9

HDAC10-201, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC10, Length 2,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-201ENST00000216271 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.93■■□□□ 1.74
HDAC10-201ENST00000216271 MAPKBP1O60336 1514 aa25.92■■□□□ 1.74
HDAC10-201ENST00000216271 TIAM1Q13009 1591 aa25.92■■□□□ 1.74
HDAC10-201ENST00000216271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-201ENST00000216271 PRDM2Q13029 1718 aa25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-201ENST00000216271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.86■■□□□ 1.73
HDAC10-201ENST00000216271 NESP48681 1621 aa25.85■■□□□ 1.73
HDAC10-201ENST00000216271 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HDAC10-201ENST00000216271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.8■■□□□ 1.72
HDAC10-201ENST00000216271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.79■■□□□ 1.72
HDAC10-201ENST00000216271 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.78■■□□□ 1.72
HDAC10-201ENST00000216271 WDR97A6NE52 1622 aa25.76■■□□□ 1.71
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HDAC10-201ENST00000216271 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
HDAC10-201ENST00000216271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.72■■□□□ 1.71
HDAC10-201ENST00000216271 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HDAC10-201ENST00000216271 TOPBP1Q92547 1522 aa25.63■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 MAP3K1Q13233 1512 aa25.62■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.62■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.61■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 BCANQ96GW7 911 aa25.6■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HDAC10-201ENST00000216271 PTPRKQ15262 1439 aa25.55■■□□□ 1.68
HDAC10-201ENST00000216271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.55■■□□□ 1.68
HDAC10-201ENST00000216271 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.55■■□□□ 1.68
HDAC10-201ENST00000216271 ARID3CA6NKF2 412 aa25.51■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.49■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.46■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 TRIM52Q96A61 297 aa25.46■■□□□ 1.67
HDAC10-201ENST00000216271 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.44■■□□□ 1.66
HDAC10-201ENST00000216271 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.44■■□□□ 1.66
HDAC10-201ENST00000216271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.43■■□□□ 1.66
HDAC10-201ENST00000216271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.43■■□□□ 1.66
HDAC10-201ENST00000216271 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.43■■□□□ 1.66
HDAC10-201ENST00000216271 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.663e-7■■■□□ 15.1
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HDAC10-201ENST00000216271 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.38■■□□□ 1.65
HDAC10-201ENST00000216271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.38■■□□□ 1.65
HDAC10-201ENST00000216271 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.36■■□□□ 1.65
HDAC10-201ENST00000216271 FKBP8Q14318 412 aa25.36■■□□□ 1.65
HDAC10-201ENST00000216271 CUL7Q14999 1698 aa25.34■■□□□ 1.65
HDAC10-201ENST00000216271 TONSLQ96HA7 1378 aa25.32■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 FMN1Q68DA7 1419 aa25.32■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 NCOA2Q15596 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.3■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.29■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 FOXD1Q16676 465 aa25.28■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.27■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 NAIPQ13075 1403 aa25.27■■□□□ 1.64
HDAC10-201ENST00000216271 GRIN2BQ13224 1484 aa25.24■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 HFM1A2PYH4 1435 aa25.24■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.24■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 SAMD9Q5K651 1589 aa25.23■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 ANP32CO43423 234 aa25.23■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 UACAQ9BZF9 1416 aa25.21■■□□□ 1.63
HDAC10-201ENST00000216271 KDM6BO15054 1643 aa25.2■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.18■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.16■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HDAC10-201ENST00000216271 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HDAC10-201ENST00000216271 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HDAC10-201ENST00000216271 CCDC184Q52MB2 194 aa25.09■■□□□ 1.61
HDAC10-201ENST00000216271 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HDAC10-201ENST00000216271 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
HDAC10-201ENST00000216271 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.07■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 CCER2I3L3R5 266 aa25.07■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.05■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.04■■□□□ 1.6
HDAC10-201ENST00000216271 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 ARHGEF11O15085 1522 aa25.01■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 L3MBTL2Q969R5 705 aa25■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HDAC10-201ENST00000216271 NEFLP07196 543 aa24.94■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.94■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 PBRM1Q86U86 1689 aa24.94■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.92■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 IQGAP2Q13576 1575 aa24.91■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HDAC10-201ENST00000216271 HECW1Q76N89 1606 aa24.88■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.87■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 WDR62O43379 1518 aa24.86■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 ADAMTS12P58397 1594 aa24.85■■□□□ 1.57
HDAC10-201ENST00000216271 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.84■■□□□ 1.57
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