RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa22.15■■□□□ 1.14
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Kdm2aP59997 1161 aa21.92■■□□□ 1.1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Aplp2Q06335 707 aa21.91■■□□□ 1.1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Calr4Q3TQS0 420 aa21.9■■□□□ 1.1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Apbb1Q9QXJ1 710 aa21.89■■□□□ 1.09
Shq1-202ENSMUST00000113312 Q8BT18 775 aa21.88■■□□□ 1.09
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ggt6Q6PDE7 497 aa21.88■■□□□ 1.09
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Ecm2Q5FW85 670 aa21.86■■□□□ 1.09
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.83■■□□□ 1.09
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rgl3Q3UYI5 709 aa21.83■■□□□ 1.09
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm6268A2A3U9 297 aa21.74■■□□□ 1.07
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ubap1lG3UW59 384 aa21.72■■□□□ 1.07
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Plcb2A3KGF7 1181 aa21.68■■□□□ 1.06
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Stk24Q99KH8 431 aa21.66■■□□□ 1.06
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm20521D3Z5F7 333 aa21.62■■□□□ 1.05
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cnga1P29974 684 aa21.61■■□□□ 1.05
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Plin1Q8CGN5 517 aa21.59■■□□□ 1.05
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stag3O70576 1240 aa21.58■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa21.57■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dbr1Q923B1 550 aa21.57■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Arhgap27A2AB59 869 aa21.56■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slc4a1apE9PX68 744 aa21.55■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Spryd3E9Q9B3 442 aa21.54■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppm1fQ8CGA0 452 aa21.54■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa21.53■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccer2J3QPU5 274 aa21.52■■□□□ 1.04
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.51■■□□□ 1.03
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Znf316Q6PGE4 1016 aa21.48■■□□□ 1.03
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Ofd1Q80Z25 1017 aa21.43■■□□□ 1.02
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Tnnt1O88346 262 aa21.41■■□□□ 1.02
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Sox12Q04890 314 aa21.36■■□□□ 1.01
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Iqcf3Q9D498 203 aa21.34■■□□□ 1.01
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pcmtd1P59913 357 aa21.33■■□□□ 1.01
Shq1-202ENSMUST00000113312 B4galnt3Q6L8S8 986 aa21.32■■□□□ 1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mical1Q8VDP3 1048 aa21.32■■□□□ 1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stk26Q99JT2 416 aa21.31■■□□□ 1
Shq1-202ENSMUST00000113312 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.27■■□□□ 1
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Vps53Q8CCB4 832 aa21.24■□□□□ 0.99
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Erich6bQ9D4S6 220 aa21.13■□□□□ 0.97
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Birc3O08863 600 aa21.09■□□□□ 0.97
Shq1-202ENSMUST00000113312 Iffo2Q8R2V2 512 aa21.08■□□□□ 0.97
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Znf330Q922H9 316 aa21.06■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 Q3TQI7 289 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tmco5bQ80X59 307 aa21.05■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.04■□□□□ 0.96
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Shq1-202ENSMUST00000113312 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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