RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm28285A0A087WQ54 102 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 A0A286YDM5 308 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm3633L7N233 213 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm9611L7N476 213 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nudt10P0C027 164 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nudt11P0C028 164 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Chrna7P49582 502 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gfra1P97785 468 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Calm5Q6W3E0 140 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NagkQ9QZ08 343 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gab2Q9Z1S8 665 aa10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr39E9PVX1 319 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sult2a2P50236 285 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gnb1P62874 340 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AdoQ6PDY2 256 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Elovl5Q8BHI7 299 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IrgcQ8C262 412 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr484Q8VFD3 321 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr338Q8VGK6 306 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NmbQ9CR53 121 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 KantrA0A1W2P7I0 76 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tspan15F7BWT7 294 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prss2P07146 246 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem95P0DJF3 176 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdk2P97377 346 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MidnQ3TPJ7 465 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dirc2Q8BFQ6 478 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GaptQ8CB93 157 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r26Q8R2D7 339 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Xrcc3Q9CXE6 349 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RprmQ9JJ72 109 aa10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ifna2P01573 190 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P04212 136 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CortP56469 109 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FshbQ60687 130 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt33bQ61897 404 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nars2Q8BGV0 477 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm26566Q8CAC1 153 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr877Q8VF62 311 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1454Q8VFW2 307 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1413Q8VGU3 323 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AmtnQ9D3J8 213 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ap5s1Q9D742 170 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8797A0A0A6YW67 77 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp764E9QAP1 431 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Degs1O09005 323 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P18528 98 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Uba52P62984 128 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vwc2lQ505H4 222 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AspaQ8R3P0 312 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 9530002B09RikQ9EPV7 135 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hsd17b6Q9R092 317 aa10.5□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arid1bE9Q4N7 2244 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fcrl6A1YIY0 268 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Npffr1E9Q468 432 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lynx1P0DP60 116 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd3eP22646 189 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm4792Q569Q2 183 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5771Q792Y9 245 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sox21Q811W0 276 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr466E9Q2B9 308 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21974F6W3F3 119 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cldn34c3J3QJW5 233 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cldn34c2J3QNM1 233 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P04219 140 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10775Q3V290 127 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc9cQ810A3 171 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm26558Q8BLW8 286 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cldn34c1Q8K193 234 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r222Q8R269 308 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1271Q8VG62 305 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndufa5Q9CPP6 116 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Opn3Q9WUK7 400 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Esp6A8R0U0 136 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700067P10RikG3X8U2 183 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AtraidQ6PGD0 223 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr399Q7TRX3 311 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snx18Q91ZR2 614 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MmdQ9CQY7 238 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndufb3Q9CQZ6 104 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DeddQ9Z1L3 318 aa10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1532-ps1A0A0R4J8U2 307 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trav12d-1A0N8R0 115 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd209gD3Z5D4 194 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms