Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
P18528 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
P18528 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
P18528 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
P18528 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
P18528 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
P18528 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
P18528 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
P18528 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
P18528 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
P18528 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
P18528 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
P18528 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
P18528 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
P18528 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
P18528 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
P18528 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
P18528 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
P18528 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
P18528 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
P18528 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
P18528 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
P18528 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
P18528 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
P18528 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
P18528 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
P18528 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
P18528 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
P18528 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
P18528 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
P18528 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P18528 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P18528 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
P18528 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
P18528 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
P18528 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P18528 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
P18528 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
P18528 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
P18528 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
P18528 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
P18528 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
P18528 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
P18528 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
P18528 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
P18528 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
P18528 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
P18528 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
P18528 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
P18528 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
P18528 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
P18528 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
P18528 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
P18528 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
P18528 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
P18528 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
P18528 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
P18528 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
P18528 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
P18528 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
P18528 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
P18528 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
P18528 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
P18528 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
P18528 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
P18528 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
P18528 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
P18528 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
P18528 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
P18528 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
P18528 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P18528 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
P18528 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
P18528 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P18528 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
P18528 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
P18528 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,6■■□□□ 1,21
P18528 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
P18528 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
P18528 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,55■■□□□ 1,2
P18528 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
P18528 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
P18528 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
P18528 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,43■■□□□ 1,18
P18528 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
P18528 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
P18528 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
P18528 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
P18528 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
P18528 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P18528 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P18528 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
P18528 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
P18528 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
P18528 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
P18528 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
P18528 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
P18528 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
P18528 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
P18528 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
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