Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Gfra1P97785 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gfra1P97785 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gfra1P97785 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Gfra1P97785 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Gfra1P97785 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Gfra1P97785 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gfra1P97785 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Gfra1P97785 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Gfra1P97785 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Gfra1P97785 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Gfra1P97785 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Gfra1P97785 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Gfra1P97785 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gfra1P97785 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gfra1P97785 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra1P97785 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Gfra1P97785 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Gfra1P97785 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra1P97785 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gfra1P97785 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gfra1P97785 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gfra1P97785 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gfra1P97785 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Gfra1P97785 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gfra1P97785 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gfra1P97785 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gfra1P97785 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Gfra1P97785 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gfra1P97785 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gfra1P97785 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gfra1P97785 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gfra1P97785 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gfra1P97785 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gfra1P97785 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gfra1P97785 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gfra1P97785 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Gfra1P97785 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Gfra1P97785 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Gfra1P97785 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gfra1P97785 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gfra1P97785 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gfra1P97785 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gfra1P97785 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gfra1P97785 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gfra1P97785 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gfra1P97785 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gfra1P97785 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Gfra1P97785 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gfra1P97785 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gfra1P97785 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gfra1P97785 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gfra1P97785 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Gfra1P97785 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gfra1P97785 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Gfra1P97785 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Gfra1P97785 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Gfra1P97785 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Gfra1P97785 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Gfra1P97785 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gfra1P97785 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gfra1P97785 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gfra1P97785 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Gfra1P97785 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,64■■□□□ 1,38
Gfra1P97785 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Gfra1P97785 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Gfra1P97785 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Gfra1P97785 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Gfra1P97785 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Gfra1P97785 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Gfra1P97785 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gfra1P97785 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gfra1P97785 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gfra1P97785 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gfra1P97785 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Gfra1P97785 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Gfra1P97785 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Gfra1P97785 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Gfra1P97785 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gfra1P97785 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Gfra1P97785 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gfra1P97785 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gfra1P97785 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Gfra1P97785 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Gfra1P97785 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gfra1P97785 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gfra1P97785 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gfra1P97785 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gfra1P97785 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gfra1P97785 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
Gfra1P97785 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gfra1P97785 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Gfra1P97785 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Gfra1P97785 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gfra1P97785 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gfra1P97785 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gfra1P97785 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gfra1P97785 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1,27
Gfra1P97785 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Gfra1P97785 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,3 ms