Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Ap5s1Q9D742 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ap5s1Q9D742 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Ap5s1Q9D742 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ap5s1Q9D742 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ap5s1Q9D742 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ap5s1Q9D742 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Ap5s1Q9D742 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Ap5s1Q9D742 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ap5s1Q9D742 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Ap5s1Q9D742 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ap5s1Q9D742 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ap5s1Q9D742 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Ap5s1Q9D742 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ap5s1Q9D742 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ap5s1Q9D742 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Ap5s1Q9D742 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap5s1Q9D742 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ap5s1Q9D742 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ap5s1Q9D742 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ap5s1Q9D742 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ap5s1Q9D742 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Ap5s1Q9D742 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Ap5s1Q9D742 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ap5s1Q9D742 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ap5s1Q9D742 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ap5s1Q9D742 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Ap5s1Q9D742 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Ap5s1Q9D742 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ap5s1Q9D742 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ap5s1Q9D742 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ap5s1Q9D742 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ap5s1Q9D742 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ap5s1Q9D742 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ap5s1Q9D742 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ap5s1Q9D742 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ap5s1Q9D742 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ap5s1Q9D742 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ap5s1Q9D742 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Ap5s1Q9D742 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ap5s1Q9D742 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Ap5s1Q9D742 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ap5s1Q9D742 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ap5s1Q9D742 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Ap5s1Q9D742 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ap5s1Q9D742 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ap5s1Q9D742 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ap5s1Q9D742 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ap5s1Q9D742 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ap5s1Q9D742 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap5s1Q9D742 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap5s1Q9D742 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap5s1Q9D742 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap5s1Q9D742 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap5s1Q9D742 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ap5s1Q9D742 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap5s1Q9D742 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ap5s1Q9D742 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ap5s1Q9D742 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ap5s1Q9D742 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ap5s1Q9D742 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ap5s1Q9D742 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ap5s1Q9D742 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Ap5s1Q9D742 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ap5s1Q9D742 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Ap5s1Q9D742 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ap5s1Q9D742 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ap5s1Q9D742 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ap5s1Q9D742 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ap5s1Q9D742 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ap5s1Q9D742 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ap5s1Q9D742 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ap5s1Q9D742 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap5s1Q9D742 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ap5s1Q9D742 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ap5s1Q9D742 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ap5s1Q9D742 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ap5s1Q9D742 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ap5s1Q9D742 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ap5s1Q9D742 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ap5s1Q9D742 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ap5s1Q9D742 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ap5s1Q9D742 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ap5s1Q9D742 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ap5s1Q9D742 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ap5s1Q9D742 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ap5s1Q9D742 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ap5s1Q9D742 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms