Protein–RNA interactions for Protein: P97377

Cdk2, Cyclin-dependent kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2P97377 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk2P97377 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk2P97377 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk2P97377 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk2P97377 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk2P97377 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk2P97377 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk2P97377 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk2P97377 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk2P97377 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk2P97377 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk2P97377 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk2P97377 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk2P97377 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk2P97377 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk2P97377 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk2P97377 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk2P97377 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk2P97377 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk2P97377 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk2P97377 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk2P97377 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk2P97377 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk2P97377 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk2P97377 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk2P97377 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk2P97377 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk2P97377 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk2P97377 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk2P97377 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk2P97377 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk2P97377 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk2P97377 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk2P97377 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk2P97377 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk2P97377 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk2P97377 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk2P97377 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk2P97377 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk2P97377 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk2P97377 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk2P97377 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk2P97377 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk2P97377 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk2P97377 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk2P97377 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk2P97377 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk2P97377 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk2P97377 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk2P97377 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk2P97377 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk2P97377 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk2P97377 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk2P97377 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk2P97377 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk2P97377 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk2P97377 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk2P97377 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk2P97377 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk2P97377 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk2P97377 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk2P97377 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk2P97377 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk2P97377 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk2P97377 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk2P97377 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk2P97377 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk2P97377 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk2P97377 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk2P97377 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk2P97377 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk2P97377 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk2P97377 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk2P97377 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk2P97377 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk2P97377 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk2P97377 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk2P97377 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk2P97377 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk2P97377 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk2P97377 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk2P97377 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk2P97377 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk2P97377 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk2P97377 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk2P97377 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk2P97377 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk2P97377 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk2P97377 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk2P97377 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk2P97377 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk2P97377 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk2P97377 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk2P97377 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk2P97377 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk2P97377 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk2P97377 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk2P97377 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk2P97377 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk2P97377 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms