Protein–RNA interactions for Protein: Q3TPJ7

Midn, Midnolin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MidnQ3TPJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MidnQ3TPJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MidnQ3TPJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MidnQ3TPJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MidnQ3TPJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MidnQ3TPJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MidnQ3TPJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MidnQ3TPJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MidnQ3TPJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MidnQ3TPJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MidnQ3TPJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MidnQ3TPJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MidnQ3TPJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MidnQ3TPJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MidnQ3TPJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MidnQ3TPJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MidnQ3TPJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MidnQ3TPJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MidnQ3TPJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MidnQ3TPJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MidnQ3TPJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MidnQ3TPJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MidnQ3TPJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MidnQ3TPJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MidnQ3TPJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MidnQ3TPJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MidnQ3TPJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MidnQ3TPJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MidnQ3TPJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MidnQ3TPJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MidnQ3TPJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MidnQ3TPJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MidnQ3TPJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MidnQ3TPJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MidnQ3TPJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MidnQ3TPJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MidnQ3TPJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MidnQ3TPJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MidnQ3TPJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MidnQ3TPJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MidnQ3TPJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MidnQ3TPJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MidnQ3TPJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MidnQ3TPJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MidnQ3TPJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MidnQ3TPJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MidnQ3TPJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MidnQ3TPJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MidnQ3TPJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MidnQ3TPJ7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MidnQ3TPJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MidnQ3TPJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MidnQ3TPJ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MidnQ3TPJ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MidnQ3TPJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MidnQ3TPJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MidnQ3TPJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MidnQ3TPJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MidnQ3TPJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MidnQ3TPJ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MidnQ3TPJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MidnQ3TPJ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MidnQ3TPJ7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MidnQ3TPJ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MidnQ3TPJ7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MidnQ3TPJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MidnQ3TPJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MidnQ3TPJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MidnQ3TPJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MidnQ3TPJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MidnQ3TPJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MidnQ3TPJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MidnQ3TPJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MidnQ3TPJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MidnQ3TPJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MidnQ3TPJ7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MidnQ3TPJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MidnQ3TPJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MidnQ3TPJ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MidnQ3TPJ7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MidnQ3TPJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MidnQ3TPJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MidnQ3TPJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MidnQ3TPJ7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MidnQ3TPJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MidnQ3TPJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MidnQ3TPJ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MidnQ3TPJ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MidnQ3TPJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms