Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L3

Dedd, Death effector domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DeddQ9Z1L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DeddQ9Z1L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DeddQ9Z1L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DeddQ9Z1L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DeddQ9Z1L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DeddQ9Z1L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DeddQ9Z1L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DeddQ9Z1L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DeddQ9Z1L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DeddQ9Z1L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DeddQ9Z1L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DeddQ9Z1L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DeddQ9Z1L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DeddQ9Z1L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DeddQ9Z1L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DeddQ9Z1L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DeddQ9Z1L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DeddQ9Z1L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DeddQ9Z1L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DeddQ9Z1L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DeddQ9Z1L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DeddQ9Z1L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DeddQ9Z1L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DeddQ9Z1L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DeddQ9Z1L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DeddQ9Z1L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DeddQ9Z1L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DeddQ9Z1L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DeddQ9Z1L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DeddQ9Z1L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DeddQ9Z1L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DeddQ9Z1L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DeddQ9Z1L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DeddQ9Z1L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DeddQ9Z1L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DeddQ9Z1L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DeddQ9Z1L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DeddQ9Z1L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DeddQ9Z1L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DeddQ9Z1L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DeddQ9Z1L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DeddQ9Z1L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DeddQ9Z1L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DeddQ9Z1L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DeddQ9Z1L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DeddQ9Z1L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DeddQ9Z1L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DeddQ9Z1L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DeddQ9Z1L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DeddQ9Z1L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DeddQ9Z1L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DeddQ9Z1L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DeddQ9Z1L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DeddQ9Z1L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DeddQ9Z1L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DeddQ9Z1L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DeddQ9Z1L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DeddQ9Z1L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DeddQ9Z1L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DeddQ9Z1L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DeddQ9Z1L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DeddQ9Z1L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DeddQ9Z1L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DeddQ9Z1L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DeddQ9Z1L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DeddQ9Z1L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DeddQ9Z1L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DeddQ9Z1L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DeddQ9Z1L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DeddQ9Z1L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DeddQ9Z1L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DeddQ9Z1L3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DeddQ9Z1L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DeddQ9Z1L3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DeddQ9Z1L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DeddQ9Z1L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DeddQ9Z1L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DeddQ9Z1L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DeddQ9Z1L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DeddQ9Z1L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DeddQ9Z1L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DeddQ9Z1L3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DeddQ9Z1L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms