Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IrgcQ8C262 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IrgcQ8C262 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IrgcQ8C262 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IrgcQ8C262 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IrgcQ8C262 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IrgcQ8C262 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IrgcQ8C262 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IrgcQ8C262 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IrgcQ8C262 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IrgcQ8C262 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IrgcQ8C262 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IrgcQ8C262 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IrgcQ8C262 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IrgcQ8C262 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IrgcQ8C262 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IrgcQ8C262 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IrgcQ8C262 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IrgcQ8C262 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IrgcQ8C262 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IrgcQ8C262 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IrgcQ8C262 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IrgcQ8C262 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IrgcQ8C262 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IrgcQ8C262 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IrgcQ8C262 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IrgcQ8C262 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IrgcQ8C262 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IrgcQ8C262 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
IrgcQ8C262 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IrgcQ8C262 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IrgcQ8C262 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IrgcQ8C262 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IrgcQ8C262 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IrgcQ8C262 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IrgcQ8C262 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IrgcQ8C262 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IrgcQ8C262 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IrgcQ8C262 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IrgcQ8C262 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IrgcQ8C262 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IrgcQ8C262 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IrgcQ8C262 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IrgcQ8C262 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IrgcQ8C262 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IrgcQ8C262 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IrgcQ8C262 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IrgcQ8C262 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IrgcQ8C262 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IrgcQ8C262 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IrgcQ8C262 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IrgcQ8C262 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IrgcQ8C262 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IrgcQ8C262 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IrgcQ8C262 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IrgcQ8C262 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IrgcQ8C262 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IrgcQ8C262 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IrgcQ8C262 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IrgcQ8C262 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IrgcQ8C262 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IrgcQ8C262 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IrgcQ8C262 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IrgcQ8C262 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IrgcQ8C262 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IrgcQ8C262 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IrgcQ8C262 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IrgcQ8C262 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IrgcQ8C262 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IrgcQ8C262 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IrgcQ8C262 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IrgcQ8C262 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IrgcQ8C262 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IrgcQ8C262 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IrgcQ8C262 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IrgcQ8C262 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IrgcQ8C262 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IrgcQ8C262 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IrgcQ8C262 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IrgcQ8C262 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IrgcQ8C262 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IrgcQ8C262 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IrgcQ8C262 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IrgcQ8C262 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IrgcQ8C262 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IrgcQ8C262 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IrgcQ8C262 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IrgcQ8C262 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IrgcQ8C262 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IrgcQ8C262 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IrgcQ8C262 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IrgcQ8C262 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IrgcQ8C262 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IrgcQ8C262 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IrgcQ8C262 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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