Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ08

Nagk, N-acetyl-D-glucosamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NagkQ9QZ08 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NagkQ9QZ08 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NagkQ9QZ08 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NagkQ9QZ08 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NagkQ9QZ08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NagkQ9QZ08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NagkQ9QZ08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NagkQ9QZ08 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NagkQ9QZ08 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NagkQ9QZ08 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NagkQ9QZ08 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NagkQ9QZ08 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NagkQ9QZ08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NagkQ9QZ08 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NagkQ9QZ08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NagkQ9QZ08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NagkQ9QZ08 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NagkQ9QZ08 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NagkQ9QZ08 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NagkQ9QZ08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NagkQ9QZ08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NagkQ9QZ08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NagkQ9QZ08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NagkQ9QZ08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NagkQ9QZ08 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NagkQ9QZ08 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NagkQ9QZ08 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NagkQ9QZ08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NagkQ9QZ08 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NagkQ9QZ08 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NagkQ9QZ08 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NagkQ9QZ08 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NagkQ9QZ08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NagkQ9QZ08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NagkQ9QZ08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NagkQ9QZ08 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NagkQ9QZ08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NagkQ9QZ08 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NagkQ9QZ08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NagkQ9QZ08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NagkQ9QZ08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NagkQ9QZ08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NagkQ9QZ08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NagkQ9QZ08 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NagkQ9QZ08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NagkQ9QZ08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NagkQ9QZ08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NagkQ9QZ08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NagkQ9QZ08 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NagkQ9QZ08 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NagkQ9QZ08 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NagkQ9QZ08 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NagkQ9QZ08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NagkQ9QZ08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NagkQ9QZ08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NagkQ9QZ08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NagkQ9QZ08 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NagkQ9QZ08 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NagkQ9QZ08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NagkQ9QZ08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NagkQ9QZ08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NagkQ9QZ08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NagkQ9QZ08 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NagkQ9QZ08 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NagkQ9QZ08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NagkQ9QZ08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NagkQ9QZ08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NagkQ9QZ08 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NagkQ9QZ08 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NagkQ9QZ08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NagkQ9QZ08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NagkQ9QZ08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NagkQ9QZ08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NagkQ9QZ08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NagkQ9QZ08 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NagkQ9QZ08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NagkQ9QZ08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NagkQ9QZ08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NagkQ9QZ08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NagkQ9QZ08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NagkQ9QZ08 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NagkQ9QZ08 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NagkQ9QZ08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NagkQ9QZ08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NagkQ9QZ08 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NagkQ9QZ08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NagkQ9QZ08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NagkQ9QZ08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NagkQ9QZ08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NagkQ9QZ08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NagkQ9QZ08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NagkQ9QZ08 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NagkQ9QZ08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NagkQ9QZ08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NagkQ9QZ08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NagkQ9QZ08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NagkQ9QZ08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NagkQ9QZ08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NagkQ9QZ08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NagkQ9QZ08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms